线粒体核糖体包含16S rRNA(大亚基)和12S rRNA(小亚基)，它们编码在线粒体基因组中，由长H链转录本加工产生(Van Haute et al. 2015)。编码于细胞核并作用于线粒体基质的酶修饰12S RNA中的5个核苷酸和16S rRNA中的4个核苷酸(Van Haute et al. 2015)。
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