SARS-CoV-1和SARS-CoV-2感染周期与人类宿主蛋白和治疗相互作用的快速和精确的分子路径建模

为应对2019冠状病毒病(COVID-19)大流行，Reactome正与COVID-19疾病地图小组合作，快速标注人类冠状病毒感染路径。我们描述了由SARS-CoV-2冠状病毒介导的COVID-19感染过程的分子注释，介导病毒感染严重程度的病毒成分和人类宿主蛋白之间的相互作用，以及治疗药物和类药物化合物对病毒和宿主蛋白的影响。SARS-CoV-2路径注释将为基于路径和网络的数据分析和可视化提供一个框架，这将对当前和未来众多COVID-19研究的解释至关重要。

我们与病毒学、药物设计和传染病领域的社区专家团队合作，分两个阶段收集信息。首先，注释草案将把相关的SARS-CoV-1和SARS-CoV-2病毒和宿主细胞蛋白与感染过程的每个阶段以及宿主对它的反应联系起来。这些注释将立即用于识别额外的相关相互作用蛋白，评估宿主或病毒蛋白的变异对病毒感染的特定步骤的可能影响，以及识别可能的药物靶标。在第二阶段，将对SARS-CoV-2图谱进行更广泛的注释，填补这些过程中每个步骤的分子细节，突出SARS-CoV-2病毒与相关冠状病毒介导的过程的差异。该注释过程将在项目期间继续进行，以纳入研究团体发现的新验证的分子细节。

在这个COVID - 19疾病路径项目中开发的所有数据、代码和工具都将是开源和开放获取的，并可免费使用和重复使用，以支持临床和转化研究项目。

该加速注释项目得到了美国国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute)最近获得的补充拨款U41 HG003751-13S1的支持。

看这个空间!我们很快就会发布视频。