每个真核细胞核糖体核糖体含有4分子的RNA：28s rRNA（酵母中25s rRNA），5.8s rRNA和50s亚基的5S rRNA和40s亚基的18s rRNA。通过单核核典的18°SRRNA，5.8S rRNA和28S rRNA由单核核酸和外核酸解加工产生单一的47s前体（Pre-RRNA）（在Henras等，2015年审阅）。核糖体RNA基因的转录，预rRNA的加工以及前体60s和40s亚基的组装发生（在Hernandez-Verdun等，2010）中审查，在细胞溶胶中发生了一些晚期反应。在核仁非转录的DNA和无活性聚合酶复合物中位于纤维状中心中，活性DNA聚合酶I转录发生在纤维状中心和致密纤维组分之间的界面处，预先加工在致密的原纤筋组分中，预rRNA的晚期加工发生在粒状成分（Stanek等人。2001）。
加工的核糖体RNA含有许多修饰的核苷酸，其由作用于前体RRNA中含有的编码核苷酸的酶产生（在博斯基-Muller和Motorin 2013中审查）。最多的多种修饰是假尿素残基和2'-O-甲基丙核苷酸。在盒C / D Snornp中的前体RRNA和小核仁RNA（Snorna）之间的碱基配对引导碱配对（在HENRAS等人2004年审核，YU和MEIER 2014）。类似地，2'-O-甲基化通过前体RRNA和盒子H / ACA SnORNP中的Snorna之间的碱基配对引导（在Henras等，2004年审查，Hamma和Ferre-d'Mare 2010）。其他修饰包括N（1） - 甲基己脲，5-甲基胞嘧啶，7-甲基胍，6-二甲基腺苷和4-乙酰胞嘧啶。当预rRNA被切割时，发生核苷酸的修饰。然而，裂解和修改步骤的顺序尚不清楚，因此这里单独呈现这两个过程。核糖体生物发生因子的缺陷会引起疾病（在Freed等人的评论中。2010）。
线粒体核糖体与细胞质核糖体完全不同，具有不同的蛋白质亚基和12S rRNA和16S rRNA。线粒体rrna编码在线粒体基因组中，由长H链转录本加工产生。rrna中的特定残基被酶修饰，产生5种不同类型的修饰核苷酸: