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对于需要为新疗法确定生物靶点的生物医学研究人员来说,Open Targets是一项基于基因组规模的实验和分析来生成治疗靶点有效性证据的公私合作倡议。

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开放的目标

包含绝大多数人类蛋白编码基因的信息,包括基于RNA和蛋白质数据的相应蛋白的表达和定位。

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人类蛋白质图谱

Ensembl是一个脊椎动物基因组浏览器,支持比较基因组学,进化,序列变异和转录调控的研究。Ensembl注释基因,计算多重比对,预测调节功能和收集疾病数据。

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运用

BLUEPRINT联盟的成立旨在进一步了解基因是如何在健康和患病的人类细胞中被激活或抑制的。

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蓝图

复杂门户是一个手工策划,大分子复合物的百科全书资源,从一些关键的模式生物。大多数复合物由蛋白质组成,但也可能包括核酸或小分子。

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复杂的门户

化学实体的生物兴趣(ChEBI)是一个免费可用的字典的分子实体集中在“小的”化学化合物。术语“分子实体”指的是任何构造上或同位素上不同的原子、分子、离子、离子对、自由基、自由基离子、络合物、构象等,可被识别为一个单独可区分的实体。

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ChEBI

蛋白质组动力学百科全书是一个多语言的持久数据库和web应用程序,提供开放访问已发表的人体细胞和模型生物研究的集成蛋白质组数据,具有图形导航和交互式可视化,以直观的方式促进强大的数据探索。

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PepTracker:环保署

PRIDE数据库是一个集中的、符合标准的蛋白质组学数据公共数据库,包括蛋白质和肽鉴定、翻译后修饰和支持光谱证据。

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骄傲

小报蛋白质组是一个蛋白质关联网络数据库,使用公开可用的质谱法在PRIDE实验基础上生成。这些关联代表了蛋白质对之间广泛的生物学关联,远远超出了单纯的二元蛋白质相互作用。

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小报蛋白质组

LINCS是一个集成LINCS数据和签名分析的web平台。BD2K- lincs数据协调与集成中心是NIH“大数据到知识”(BD2K)计划的一部分。

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iLINCS

集成蛋白质组学应用提供了一个全面的蛋白质组数据分析解决方案,集成蛋白质组学管道(IP2),允许研究人员在一个易于使用的界面上识别、量化和功能分析生物样品中的所有蛋白质。

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异丙醇

PINT,蛋白质组学整合器,是一个在线实验库,用于收集来自不同的定性和/或定量蛋白质组学分析的最终结果。PINT是一种新的综合系统,用于存储、可视化和分析不同实验条件下的蛋白质组学结果的数据。

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一品脱的量

靶病原体数据库是一种生物信息学方法,用于区分和识别病原体的候选药物靶点。设计和开发的在线资源,允许基因组广泛的数据整合,从不同的来源集中在结构药物性,重要性和代谢作用的蛋白质。

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Target-Pathogen

生物模型是生物和生物医学系统的数学模型库。它拥有大量现有的基于标准格式的生理和药物相关机制模型的文献选择。我们的任务是为系统建模社区提供可复制的、高质量的、可自由访问的科学文献模型。

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BioModels

Pharos是照亮药物基因组(IDG)计划的知识管理中心(KMC)的用户界面。

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灯塔

UniProt开发了阿尔茨海默病门户网站,帮助研究人员从UniProtKB数据库中探索和访问当前的AD基因组数据。

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