简单的文本搜索
简单的文本搜索工具位于主页的右上方。要进行搜索，请在搜索框中键入单词、短语或标识符。搜索具有自动完成功能;如果您想要使用的文本出现在下拉列表中，选择它，结果就会显示出来。对于其他文本，请单击搜索。
搜索结果以带有灰色标题的类别显示，表示分子实体或事件类型。
标题下方是命名类型中与搜索词匹配的项目列表。匹配的单词以灰色突出显示。单击项目名称可转到详细信息页面。
在搜索结果页面的左侧是多组复选框。这些可用于更改默认值和添加过滤器。勾选或取消勾选您不想看到的类型，例如，如果您想看到小家鼠的结果，请在“物种”下取消勾选“智人”并勾选“小家鼠”。在类型、隔室和反应类型过滤器组中，选择仅查看属于所选类别的结果，例如，要仅查看反应，请在类型过滤器组中选择反应。若要仅查看胞质溶胶中发生的反应，请选择“隔间中的胞质溶胶”。
单击任何结果可转到有关该结果的信息页面。这些结果详细信息页面的内容将取决于类型，但都有一个名为“PathwayBrowser中的位置”的部分。
它包含一个可扩展的层次结构，用于标识Reactome路径图中项目的位置。单击加号以打开层次结构。
此层次结构反映了Reactome中事件的组织。”代表广泛生物学领域的顶级路径通常包含一个或多个级别的子路径，每个级别的子路径变得更加具体。层次结构的层次在这里用缩进表示；最普通的路径最靠近屏幕的左边缘，最特殊的子路径最靠近屏幕的右边缘。请注意，一些搜索结果项（例如蛋白质）可能位于多个途径中，这些途径可能位于不同的生物学广泛领域，从而导致在多个层次中的表示。请注意，只需单击右侧的“全部展开”链接，即可打开所有层次结构级别。选择任何事件名称以打开相应的路径图。该图将以动画打开，显示路径在路径概述中的位置。如果所选项目是一个事件，它将在路径图中以蓝色突出显示。如果它是一种蛋白质，它的所有实例都将以粉红色突出显示。
图标搜索
图标库的元素可在主网站搜索。下面的截图显示了“肝脏”一词的搜索结果。
标题下方是“图标”类型中与“肝脏”搜索词匹配的项目列表。匹配的单词以灰色突出显示。单击项目名称可转到详细信息页面。下图显示了选择第一个搜索结果
将显示与选定图标关联的元数据，包括图标类别、管理器和设计器，以及图标的简要描述。要下载图像图标文件，请单击预览图像的战斗链接。在页面下方是一系列可扩展的层次链接，用于标识Reactome路径图中图标的位置。单击加号以打开层次结构。单击页面底部的外部链接，将链接到指定图标的引用数据库。
在图中搜索（在路径浏览器中搜索）
搜索可以在路径浏览器中使用图内搜索面板(路径面板的左上角)执行。当路径概述，图是增强的高层图(EHLD)显示时，搜索所有的Reactome。
途径搜索概述
在下面的例子中，搜索词“IL6”已经输入。搜索工具预测匹配该搜索项的结果，并显示这些匹配项的下拉列表。
注意:深蓝色的条，表示有23个结果显示。结果窗口中只有这三个结果清晰显示。要查看其他结果，将光标移到窗口上方并向下滚动。每个结果项都有一个符号(在左边)表示它是分子或事件的类型。第一个结果，在名字的左边有一个蓝色的圆圈图标，表示与位于质膜中的IL6R蛋白匹配。第二个结果，在左边有一个双螺旋图标，是IL6R基因。第三个结果是一种反应显示左侧方框上方/下方的图标，通过向右箭头连接到右侧方框，表示IL6到IL6R的绑定. 还为显示的每个分子或事件类型提供了反应组稳定标识符和细胞室注释。
在下图中，最近的搜索结果显示在搜索结果窗口的底部。点击“清除历史记录”按钮将从历史记录中删除搜索词。
在下一张图片中，在搜索结果面板中选择一个项目还会出现第二个下拉式搜索结果详细信息面板。显示的附加注释包括分子或事件类型、Reactome稳定标识符、外部参考数据库标识符和单元格。点击搜索栏右侧的“过滤”按钮，将显示按分子或事件类型过滤搜索结果的选项，例如:途径、反应、复合物、蛋白质、DNA序列、集合等。选择一个或多个过滤器将限制所查看的搜索结果。取消选择过滤器将改变搜索结果的显示。在初始搜索结果面板中选择一个项目将导致“概述”缩放并重新居中，聚焦于表示包含所选项目的路径的区域。这将标识所选项目并列出包含所选项目的路径。
在下图中，将光标移动到路径名称上(在“Present In X路径”下)，如果它在视图中可见，将在Overview中突出显示相应的路径。工具提示将显示路径的名称。
在搜索结果详细面板中点击路径名称(在“在X路径中呈现”下)，将在概述中选择相应的对象。如果不可见，路径图将重新居中显示它。在搜索结果详细信息面板中双击路径名称或按“GO >>>”按钮将打开相应的路径图。如果需要返回到Overview，可以使用浏览器的后退按钮。请注意在上图中，“搜索结果详细信息”面板超出了“概述”窗口的限制，因此某些结果被隐藏。这就解释了为什么结果详细说明标题中说存在于3条途径中，但只有2条是可见的。要查看所有匹配路径，请单击“搜索结果详细信息”面板中的路径列表。
在下图中，已单击搜索结果详细信息面板（IL6R右侧）中的“标志”按钮，包含所选分子的事件以蓝色突出显示，连接的事件以紫色突出显示。再次单击“标志”按钮将删除事件突出显示。
搜索路径图
在下面的示例中，搜索已经识别了IL6R，并生成了一个匹配的下拉列表。第一个匹配是蛋白质，如左边的图标所示。第二个与显示双螺旋的图标相匹配的是DNA序列或基因。请注意，如果IL6R在图中的两个细胞室中表示，它将在初始搜索结果中出现两次。对于搜索结果中的每个分子或事件类型，还提供了Reactome稳定标识符和单元格注释。注意:当输入搜索项时，搜索工具将预测与该搜索项匹配的结果，并显示这些匹配项的下拉列表。
虽然下面没有显示，但是当执行新的搜索时，最近的搜索结果会显示在搜索结果窗口的底部。点击“清除历史记录”按钮将从历史记录中删除搜索词。
深蓝色高亮显示条，表示“此图”中显示了3个结果。结果窗口中仅清楚显示这两个结果。要查看其他结果，请将光标移动到窗口上并向下滚动。每个结果项都有一个符号（在左边），表示它所属的分子或事件的类型。第一个结果在名称左侧有一个蓝色圆圈图标，表示与位于质膜中的IL6R蛋白相匹配。第二个结果是IL6R基因，左边有一个双螺旋图标。还为显示的每个分子或事件类型提供了反应组稳定标识符和细胞室注释。
在下一张图片中，点击“过滤”按钮(在搜索栏的右侧)，将显示按分子或事件类型过滤搜索结果的选项，例如:途径、反应、复合物、蛋白质、DNA序列、集合等。选择一个或多个过滤器将限制所查看的搜索结果。取消选择过滤器将改变搜索结果的显示。
在下一幅图像中，在“搜索结果”面板中选择一个项目也会导致出现第二个下拉搜索结果详细信息面板。在细节面板的顶部，会显示其他注释，包括分子或事件类型、反应组稳定标识符、外部参考数据库标识符（如果适用）和细胞室。下面列出了其他注释，描述了图中蛋白质在复合物、集合和反应中的参与。在搜索结果详细信息面板中选择名称将在路径图中选择相应的对象。如果不可见，路径图将重新居中显示它。
在这个查询示例中，点击搜索结果详细信息面板(IL6R右边)中的“Flag”按钮将突出显示图中包含IL6R的所有(15)对象。点击“Flag”按钮第二次(或路径视图底部的“X”按钮)将删除对象高亮显示。要查看所有匹配，需要调整路径图面板的大小。
在下图中，在搜索结果面板中选择第二个项目(IL6绑定IL6R)，将出现第二个下拉式搜索结果详细信息面板。在Details Panel的顶部，显示了附加的注释，包括事件类型、Reactome稳定标识符和单元格。下面列出了附加的注释，描述了图中反应的参与情况，以及反应的参与者。在搜索结果详细信息面板中选择名称将在路径图中选择相应的对象。如果不可见，路径图将重新居中显示它。在这张图片中，IL6结合IL6R反应以蓝色突出显示。
在下一张图片中，当在搜索结果面板中选择一个项目时，点击“All diagram”选项卡将会显示一组不同的结果。与前面一样，在Details Panel的顶部显示了附加的注释，包括分子或事件类型、Reactome稳定标识符、外部引用数据库标识符(如果适用)和单元格。不是在当前显示的路径中显示对象，而是显示包含搜索项的路径视图中未显示的路径。
在Search Results Detail Panel(“Present in n pathway diagram”)中选择超链接的路径名称，将在路径浏览器中打开新的路径图，并在新路径图中选择相应的对象。
在增强的高级关系图（EHLD）中搜索
在下面的示例中，搜索已经识别了IL6R，并生成了一个匹配的下拉列表。第一个匹配是蛋白质，如左边的图标所示。第二个与显示双螺旋的图标相匹配的是DNA序列或基因。请注意，如果IL6R在图中的两个细胞室中表示，它将在初始搜索结果中出现两次。对于搜索结果中的每个分子或事件类型，还提供了Reactome稳定标识符和单元格注释。注意:当输入搜索项时，搜索工具将预测与该搜索项匹配的结果，并显示这些匹配项的下拉列表。
虽然下面没有显示，但是当执行新的搜索时，最近的搜索结果会显示在搜索结果窗口的底部。点击“清除历史记录”按钮将从历史记录中删除搜索词。
深蓝色高亮条，表示“This diagram”中有23个结果，“All diagrams”中有30个结果。结果窗口中只有两个结果清晰显示。要查看其他结果，将光标移到窗口上方并向下滚动。每个结果项都有一个符号(在左边)表示它是分子或事件的类型。第一个结果，在名字的左边有一个蓝色的圆圈图标，表示与位于质膜中的IL6R蛋白匹配。第二个结果，在左边有一个双螺旋图标，是IL6R基因。还为显示的每个分子或事件类型提供了Reactome稳定标识符和细胞间隔注释。
在下图中，在搜索结果面板(IL6R)中选择第一项将出现第二个下拉式搜索结果详细信息面板。在Details Panel的顶部，会显示额外的注释，包括分子或事件类型、Reactome稳定标识符和单元格。下面列出了附加的注释，描述了在EHLD中对象的参与情况。在搜索结果详情面板中选择路径名称将在EHLD中选择相应的对象。如果它不可见，EHLD将重新中心显示在
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搜索练习
这个练习鼓励您通过菜单栏和搜索来查找信息
- Reactome主页上最新的新闻是什么?
- 反应组中代表了多少人类蛋白质？
- 下一个版本中列出的第一项内容是什么?
- VAV2在Reactome吗?
- 有多少反应涉及VAV2?
- 有包含VAV2的复合物吗?
- CRB2在Reactome吗?
