Reactome路径图查看器提供了查看路径图并与之交互的直观方法。路径图将路径的步骤表示为一系列相互关联的分子事件,在反应组中称为“反应”。

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Reactome是人类生物学中路径和反应(路径步骤)的精选数据库。“反应”的反应体定义包括生物学中许多状态变化的事件,如结合、激活、易位和降解,以及经典的生化反应。数据库中的信息由专家生物学家编写,由Reactome编辑人员维护,并广泛交叉引用其他资源,如NCBI、Ensembl、UniProt、UCSC基因组浏览器、HapMap、KEGG(基因和化合物)、ChEBI、PubMed和GO。推断的同源反应适用于许多非人类物种,包括小鼠、大鼠、鸡、河豚鱼、蠕虫、苍蝇、酵母、大米和拟南芥。

diagram viewer直接从Reactome服务器检索信息,这意味着对于第三方资源,直接将其包含在支持CORS的浏览器中,或者通过添加代理机制来避免SOP。图表查看器的另一个重要功能(也可以从第三方应用程序中使用)是分析结果覆盖。如果您有兴趣了解更多有关Reactome分析服务的信息,请查看分析服务开发者指南稍后,请查看图表查看器美国石油学会.

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目前,在web应用程序中集成Reactome的路径图有两种选择。首先是使用我们的DiagramJs小部件,而第二个选项涉及使用GWT实现.

美国石油学会

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