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内容服务构成了一个简单的API提供对Reactome知识库的访问。Reactome的信息由生物学专家撰写，由Reactome编辑人员维护，并广泛交叉引用其他资源，如NCBI, Ensembl, UniProt, UCSC Genome Browser, HapMap, KEGG(基因和化合物)，ChEBI, PubMed和GO。它还包含推断的同源反应超过20个非人类物种，包括小鼠，大鼠，鸡，河豚鱼，蠕虫，苍蝇，酵母，大米，拟南芥和大肠杆菌。此外，内容服务提供了从PSICQUIC集成的分子交互访问。
内容服务基于具象状态传输(Representational State Transfer, REST)协议。这消除了对复杂客户机的需求，并使服务更简单、更轻量级、更灵活，因此，与SOAP/WSDL对应的服务相比，更容易集成到第三方软件中。
的API包括一组根据功能分组的方法。例如，扩大路径组揭示了一组方法，这些方法提供了关于路径的特定信息，如所包含的Events或参与的PhysicalEntities。所有方法都指定为GET或POST请求。GET和POST是不可互换的。展开特定的方法提供有关其输入和输出参数的更多信息，以及供用户尝试的简单测试用例。此外，用户还可以使用任何命令行客户端，如wget或旋度访问方法。
值得一提的是，为了有效地使用这个API，用户需要了解Reactome数据模型和模式．
开始
让我们从一个最基本的例子开始;检索数据库的版本。可以通过查询“/data/database/version”方法来解决:
curl -X GET——header 'Accept: text/plain' '//www.joaskin.com/ContentService/data/database/version'
响应将是一个“文本/普通”文件，只包含发布的编号。
检索反应的信息Mad1结合着丝粒标识符是r - hsa - 141409，查询如下:
curl -X GET——header 'Accept: application/json' '//www.joaskin.com/ContentService/data/query/R-HSA-141409'
响应的格式为“application/json”:
{dbId: 141409, displayName: "Mad1 binding kinetochore"， stId: "R-HSA-141409"， created: {dbId: 143430, displayName: "Yen, T, 2004-05-05 00:00:00"， dateTime: "2004-05-05 05:00:00.0"， schemaClass: "InstanceEdit"}， modified: {dbId: 1591212, displayName: "Matthews, L, 2011-09-08"， dateTime: "2011-09-08 21:45:40.0"， schemaClass:"InstanceEdit"}， isInDisease: false, isInferred: false, name: ["Mad1 binding kinetochore"]， speciesName: "Homo sapiens"， author: [143430]， compartment: [{dbId: 70101, displayName: "cytosol"， accession: "0005829"， databaseName: "GO"，定义:“细胞质中不包含细胞器但包含其他颗粒物质的部分，如蛋白质复合物。”，名称:"cytosol"， url: "http://www.ebi.ac.uk/ego/QuickGO?mode=display&entry=GO:0005829"， schemaClass: "EntityCompartment"}]，文献参考:[{dbId: 143441, displayName:“有丝分裂检查点蛋白HsMAD1和HsMAD2与间期的核孔复合物相关”，标题:“有丝分裂检查点蛋白HsMAD1和HsMAD2与间期的核孔复合物相关”，期刊:“J Cell Sci”，页数:“953-63”，pubMedIdentifier: 11181178，卷:114，年:2001，网址:"http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11181178"， schemaClass: "LiteratureReference"}]， species: [{dbId: 48887, displayName: "Homo sapiens"， name: ["Homo sapiens"， "H. sapiens"， "Hs"， "human"， "man"]， taxId: "9606"， schemaClass: " species "}]， summary: [{dbId: 143355, displayName: ""]， text:“Mad1协会与着丝粒是第一步Mad2介导信号放大的过程中从有缺陷的着丝粒。”,schemaClass:“求和”}),输入:[{dbId: 141433年,displayName:“MAD1L1(胞质)”,他说:“r - hsa - 141433”,名字:“MAD1L1”、“HsMad1”,speciesName:“智人”,consumedByEvent:[141409]， endCoordinate: 718, referenceType: "ReferenceGeneProduct"， startCoordinate: 1, schemaClass: " entitywithaccessionsequence "}， {dbId: 141398, displayName: "Kinetochore Complex [cytosol]"， stId: "R-HSA-141398"， name: ["Kinetochore Complex"]， specesname: "Homo sapiens"， consumedByEvent: [141409]， schemaClass:"GenomeEncodedEntity"}]，输出:[{dbId: 141441, displayName: "Mad1:动粒载体复合物[cytosol]"， stId: "R-HSA-141441"， name: ["Mad1:动粒载体复合物"]，speciesName: "Homo sapiens"， producedByEvent: [141409]， hasComponent: []， schemaClass: " complex"}， schemaClass: "Reaction"}
在前面的结果中，有几个json字段键，如dbId、displayName、stId、name、compartment、literatureReference等。如果我们只对特定字段感兴趣，例如隔间，查询将如下所示:
curl -X GET——header 'Accept: text/plain' '//www.joaskin.com/ContentService/data/query/R-HSA-141409/compartment'
在这种情况下，因为室是一个对象，结果将是一个TSV文件，其中第一列是对象的标识符，第二列是对象的displayName，第三列是对象的schemaClass:
70101细胞溶质EntityCompartment
如果查询的属性是原始的类型:
curl -X GET——header 'Accept: text/plain' '//www.joaskin.com/ContentService/data/query/R-HSA-141409/displayName'
然后返回的值是它在一个“文本/普通”响应中的内容:
Mad1结合着丝粒
作为本节的最后一个例子，让我们看看如何检索前面例子中使用的反应的参与分子。为此，我们调用getParticipatingPhysicalEntities方法:
curl -X GET——header 'Accept: application/json' '//www.joaskin.com/ContentService/data/event/R-HSA-141409/participatingPhysicalEntities'
响应的格式为“application/json”:
[{dbId: 141398, displayName: "Kinetochore Complex [cytosol]"， stId: "R-HSA-141398"， name: ["Kinetochore Complex"]， speciesName: "Homo sapiens"， schemaClass: "GenomeEncodedEntity"}， {dbId: 141433, displayName: "MAD1L1 [cytosol]"， stId: "R-HSA-141433"， name: ["MAD1L1"， "HsMad1"]， speciesName: "Homo sapiens"， endCoordinate:718, referenceType: "ReferenceGeneProduct"， startCoordinate: 1, schemaClass: "EntityWithAccessionedSequence"}， {dbId: 141441, displayName: "Mad1:kinetochore complex [cytosol]"， stId: "R-HSA-141441"， name: ["Mad1:kinetochore complex"]， speciesName: "Homo sapiens"， hasComponent: []， schemaClass: " complex"}]
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