使命宣言

REACTOME是一个开源、开放获取、手工策划和同行评审的路径数据库。我们的目标是为路径知识的可视化、解释和分析提供直观的生物信息学工具，以支持基础和临床研究、基因组分析、建模、系统生物学和教育。Reactome项目成立于2003年，由林肯·斯坦领导OICR彼得·德·尤斯塔奇奥(Peter D’eustachio)NYULMCHenning Hermjakob的EMBL-EBI，和吴冠明也是OHSU．

Reactome项目

近年来，生物信息变得如此丰富和复杂，即使对专家个人来说，也很难(如果不是不可能的话)用传统的出版格式和现有的知识管理工具进行管理。对于研究人员来说，在不花费太多时间收集无关信息的情况下，保持他们所在领域的最新研究进展，确定相关研究以支持他们自己的研究，是一个持续的挑战。Reactome组已经认可这一挑战和发展一套新颖的在线资源,使用电子媒体的特点来组织生物路径信息的方式提供,以便更有效地访问,允许新形式的分析,这是不可能的信息存储在传统的印刷文学。

Reactome的基础是一个免费的、开放源代码的信号和代谢分子及其组织成生物途径和过程的关系数据库。Reactome数据模型的核心单元是反应。参与反应的实体(核酸、蛋白质、复合物、疫苗、抗癌疗法和小分子)形成一个生物相互作用网络，并分组为通路。Reactome中生物途径的例子包括经典的中间代谢，信号，转录调控，细胞凋亡和疾病．Reactome对路径的筛选过程类似于科学评论的编辑。外部领域专家提供他或她的专业知识，管理员将其形式化到数据库结构中，外部领域专家审查表示。一个证据跟踪系统确保所有的断言都有原始文献的支持。

Reactome网站旨在为用户提供一幅已知生物过程和路径的图形地图，用户也可以通过该界面“点击”获得有关成分及其关系的权威详细信息。Reactome数据库和网站使科学家、研究人员、学生和教育工作者能够发现、组织和利用生物信息来支持数据可视化，集成和分析．Reactome pathway, reaction and molecules页面广泛交叉引用了超过100种不同的在线生物信息学资源，包括NCBI Gene, Ensembl和UniProt数据库，UCSC Genome Browser, ChEBI小分子数据库和PubMed文献数据库。

Reactome被临床医生、遗传学家、基因组学研究人员和分子生物学家用来解释高通量实验研究的结果，被生物信息学家用来开发从基因组研究中挖掘知识的新算法，被系统生物学家用来建立正常和疾病变异途径的预测模型。

所有的数据和软件都是免费的下载．交互作用、反应和通路数据以可下载的平面形式提供，Neo4j GraphDB，MySQL，BioPAX，用和PSI-MITAB文件，也可以通过Web服务api访问。Reactome数据库、网站和数据输入工具的本地安装软件和说明也可用来支持独立的路径管理。

如果您有任何反馈或问题，请通过Reactome与我们联系此电子邮件地址正受到垃圾邮件程序的保护。您需要启用JavaScript才能查看它。．