相关生物信息学资源之间的相互链接不仅鼓励相互交流,而且确保Reactome用户在浏览我们的网站时可以快速链接到源参考材料。此外,许多Reactome访问者是通过许多整合了Reactome数据的生物信息学资源来访问这个网站的。这些资源包括UniProt、Genecards、OMIM、NCBI Biosystems、MSigDB、HGNC、NextProt、BioGPS、Pathway Commons和Wikipathways。

我们的目标是为每种标识符(即蛋白质(UniProt)、gene (Ensembl和NCBI)、small molecule (ChEBI)和microRNA (miRBase))将源数据库标识符连接到:

  1. 最低层次的路径图或路径的子集,
  2. 所有的水平路径图,所有的反应事件。

标识符映射文件可以从下载部分。

另一种链接到Reactome的策略可以通过创建url来实现,其中包含来自“外部”数据库的名称和标识符,格式如下://www.joaskin.com/content/query?cluster=true&q=identifier

点击在这里查看外部数据库和当前Reactome版本中可用的标识符列表

以下是一些具体的例子: