与宿主细胞的mrna一样，流感病毒mrna也被封顶和聚腺苷化(Neumann, 2004)。然而，甲基化的帽会从宿主细胞mrna中被清除，并作为病毒RNA合成的引物，这一过程被称为“帽抓取”(Krug, 1981;哈根,1994)。PB2聚合酶蛋白与帽结合，激活PB1对宿主mRNA的内切。病毒信息上的3' poly-A束是由聚合酶在模板vRNA 5'末端附近的poly-U束上结巴生成的(Robertson, 1981;郑,1999)。第二个过程允许宿主细胞多聚腺苷酸化过程被抑制时病毒mrna的多聚腺苷酸化(Engelhardt, 2006;阿莫林,2006)。值得注意的是，早期转录本(包括NP和NS1)在晚期转录本(M1、HA和NS2)之前就在细胞质中积累，并且以不同的丰度，表明有额外的控制机制调节病毒基因表达(Shapiro, 1987;Hatada, 1989; Amorim, 2006).