与病毒RNA聚合酶PB2亚基结合的宿主细胞mRNA被病毒RNA聚合酶PB1亚基的内切酶活性剪切,宿主mRNA的5'末端加10-13个核苷酸仍然与聚合酶复合物结合(Plotch, 1981;克鲁格,1981;哈根,1994;李思慈,1995,李,1998;李,2001)。病毒mRNA可能会受到聚合酶复合物本身的保护,而聚合酶复合物会紧密结合带帽病毒mRNA (Shih, 1996)。在PB1病毒RNA聚合酶亚基的RNA聚合酶活性的催化下,一个鸟嘌呤残基,与vRNA中的胞嘧啶互补,被添加到宿主来源的帽上(Beaton, 1981;丰田章男,1986)。