病毒聚合酶复合物产生带有宿主细胞衍生的5'甲基帽的阳性意义病毒mRNA。由M和NS vRNA片段7和8转录的交替剪切mRNA，分别产生M2和NEP/NS2的剪切mRNA，被认为与细胞剪接和输出机制耦合(Lamb, 1980;羊肉,1981;陈,2000;李,2001)。由于第7段和第8段各编码两个蛋白质，剪切必须进行调节，允许可选择的mrna，剪切产物占少数(约10%)。M1剪接可能受到病毒聚合酶和细胞SR剪接蛋白SF2/ASF的调控(Shih, 1995;施,1996);而NS1剪接似乎是由病毒mRNA内在调控的(Alonso-Caplen, 1991;Valcarel, 1991)。