哺乳动物的TLR3, TLR7, TLR8, TLR9是内体受体，可以感知从内吞/吞噬细菌、病毒或寄生虫释放的核酸。这些tlr有一个面对核内体管腔的配体识别域(在拓扑上相当于细胞外部)，一个跨膜域和一个面对胞质的信号域。

正常情况下，由于受体区段化、转运和蛋白水解等多个水平的调控，tlr无法识别自核酸(Barton GM et al 2006, Ewald SE et al 2008)。在稳定状态下，TLR3, TLR7, TLR8, TLR9主要位于内质网(ER)，然而，它们被特定配体激活只发生在酸化的内溶酶体室(Hacker H et al 1998, Funami K et al 2004, Gibbard RJ et al 2006)。一些伴侣蛋白与内质网的tlr结合，提供高效的内溶酶体易位。TLR7和TLR9的外结构域在到达内溶酶体区时被半胱氨酸内蛋白酶水解。TLR9全长和切割后的c端均与cpg寡脱氧核苷酸结合，但有人提出只有经过处理的受体具有功能。

虽然Ewald等人2011年也报道了类似的TLR3切割，但其他研究表明TLR3外结构域的n端区域与配体结合有关，因此TLR3可能是一个全长受体(Liu L et al . 2008, Tokisue T et al . 2008)。

没有关于TLR8处理的数据，尽管TLR8的细胞生物学可能与TLR9和TLR7（Gibbard RJ等，Wei T等2009）类似。