在酸化的底糖体间隔内发生TLR3,7,8和9激活。抑制内体酸化与Bafilomic蛋白A或氯喹和氯喹氏TLR对病原体衍生核酸的反应(黑客H等1998,Funami K等,2004,Gibbard RJ等,Kuznik A等2011)。在刺激后,TLR3,7和9(并且可能TLR8)通过UNC93B1将其传送到信号传导的内体,由此它们变成功能性受体并与其特定配体结合(Kim等人2008,Ewald等,2011)。虽然UNC93B1批判性地参与TLRS贩运,但是对于这些TLRS的配体结合可分配(Kim YM等人)。