除KDM1A之外的所有表征赖氨酸脱甲基酶属于含有族的Jumonjic结构域（JMJC）.JMJC KDMS是单核Fe（II）依赖性氧酶的柴油超家族的成员，其特征在于双链β螺旋的存在核心折叠。JMJC KDMS需要2个Okoglutarate（2 og）和分子氧作为Co底物，生产，以及甲醛，琥珀酸盐和二氧化碳。该基于羟基化的机制不需要质子化赖氨酸E胺基，因此JMJC含有去甲基酶能够去甲基化物三，二和单甲基化赖氨酸。
KDM6A（UTX），KDM6B（JMJD3），KDM6C（UTY）和KDM7A（JHDM1D）催化组蛋白H3（H3K27ME2 / 3）的二甲基化赖氨酸-28的去甲基化（Agger等，2007，Cho等。2007年，de Santra等。2007年，洪等人。2007，Lan等人，2007，Lee等人，2007，Horton等人2010，Huang等人2010，Walport等，2014）。
