从“KDM6A,KDM6B,KDM7A去甲基化物ME3K28-MEDONE H3”转换为BIOPAX途径在反应数据库中。 从左到右 KDM6A、KDM6B、KDM7A使Me3K28组蛋白H3去甲基化 除KDM1A外,所有具有特征的赖氨酸去甲基酶都属于jumonjiC结构域(JmjC)包含家族。JmjC kdm是单核Fe (II)依赖加氧酶Cupin超家族的成员,其特征是存在双链β -螺旋核心折叠。JmjC kdm需要2个氧戊二酸(2 OG)和分子氧作为共底物,与甲醛、琥珀酸和二氧化碳一起产生。这种基于羟基化的机制不需要质子化的赖氨酸胺基,因此含有去甲基酶的JmjC能够去甲基三、二和单甲基赖氨酸。< br > KDM6A (UTX) KDM6B (JMJD3) KDM6C (UTY)和KDM7A (JHDM1D)催化的脱甲基di或tri-methylated lysine-28的组蛋白H3 (H3K27Me2/3)(阿格et al . 2007年,赵等。2007年,德Santra等。2007年,香港et al . 2007年,局域网等。2007年,李等人。2007年,霍顿et al . 2010年,黄光裕等人。2010年,Walport et al . 2014年)。 撰写:jupe,s,2013-03-12 审查:斯科菲尔德,克里斯托弗J,2014-05-08 审查:路易丝沃尔波特,2014-05-08 评论:Hopkinson, Richard, 2014-05-08 编辑:朱佩,S,2014-02-05 2 2-Oxoglutarate. 2-酮戊二酸 alpha-ketoglutarate 反应DB_ID:113671 骨髓 基因本体论 GO:0005654 2-氧代流(2-)[Chebi:16810] 2-oxoglutarate (2 -) 2- ketoglutarate. alpha-ketoglutarate 2-氧代戊烷二酸,离子(2-) 2-Oxoglutarate. Chebi. CHEBI: 16810 Reactome数据库ID版本77 113671 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=113671 反应途径 R-ALL-113671 4 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113671.4 反应途径 http://www.reacectome.org. 化合物 C00026. 额外的信息 MI. MI:0361 O2 氧气 氧气 反应DB_ID:113685 分子氧(ChEBI: 15379) 氧气 Chebi. Chebi:15379 Reactome数据库ID版本77 113685 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=113685 反应途径 r-all-113685 3. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113685.3 化合物 C00007 从反垃圾中的EntitySet转换 ME3K28-组蛋白H3 Me3K28-replicative组蛋白H3 ME3K28-复制依赖性组蛋白H3 ME3K28-HIST1H3A,ME3K28-HIST2H3A 反弹DB_ID:5649781 HIST1H3A Me3K28-HIST1H3A h31_human. Reactome DB_ID: 4754169 UNIPROT:P68431 H3C1 H3C1 H3FA HIST1H3A H3C2 H3FL HIST1H3B H3C3 h3fchist1h3c. H3C4 H3FB HIST1H3D H3C6 H3FD HIST1H3E H3C7 H3FI HIST1H3F H3C8 H3FH HIST1H3G H3C10 H3FK HIST1H3H H3C11 H3FF HIST1H3I H3C12 H3FJ HIST1H3J 核小体的功能核心成分。核小体将DNA包裹并压缩到染色质中,限制DNA进入需要DNA作为模板的细胞机制。因此,组蛋白在转录调节、DNA修复、DNA复制和染色体稳定性中起着核心作用。DNA可及性通过组蛋白的一组复杂翻译后修饰(也称为组蛋白编码)和核小体重塑来调节。亚单位核小体是一种组蛋白八聚体,包含两个分子,分别为H2A、H2B、H3和H4,组装在一个H3-H4异四聚体和两个H2A-H2B异二聚体中。八聚体包裹了约147 bp的DNA。发育阶段在S期表达,然后在分化过程中随着细胞分裂的减慢表达强烈降低。PTM乙酰化通常与基因激活有关。Lys-10(H3K9ac)上的乙酰化损害Arg-9(H3R8me2s)的甲基化。Lys-19(H3K18ac)和Lys-24(H3K24ac)上的乙酰化有利于Arg-18(H3R17me)的甲基化。EP300/p300在Lys-123(H3K122ac)处的乙酰化在染色质结构中起着中心作用:定位于组蛋白八聚体表面并刺激转录,可能通过促进核小体不稳定性。精氨酸-9(H3R8ci)和/或精氨酸-18(H3R17ci)处的PTM瓜氨酸化PADI4损伤甲基化并抑制转录。CARM1在Arg-18(H3R17me2a)的PTM不对称二甲基化与基因激活有关。PRMT5在Arg-9(H3R8me2s)的对称二甲基化与基因抑制有关。PRMT6在Arg-3(H3R2me2a)处的不对称二甲基化与基因抑制有关,并与H3-Lys-5甲基化(H3K4me2和H3K4me3)相互排斥。H3R2me2a存在于基因的3'端,无论其转录状态如何,并且在非活性启动子上富集,而在活性启动子上缺失。Lys-5(H3K4me)、Lys-37(H3K36me)和Lys-80(H3K79me)的PTM甲基化与基因激活有关。Lys-5(H3K4me)的甲基化促进H3和H4的后续乙酰化。Lys-80(H3K79me)的甲基化与DNA双链断裂(DSB)反应相关,是TP53BP1的特异性靶点。Lys-10(H3K9me)和Lys-28(H3K27me)的甲基化与基因抑制有关。Lys-10(H3K9me)处的甲基化是HP1蛋白(CBX1、CBX3和CBX5)的特异性靶点,可防止随后在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化以及H3和H4的乙酰化。赖氨酸-5(H3K4me)和赖氨酸-80(H3K79me)的甲基化需要在“赖氨酸-120”处对H2B进行初步的单泛素化。Lys-10(H3K9me)和Lys-28(H3K27me)的甲基化在非活性X染色体染色质中富集。G1期EHMT2/G9A在Lys-57(H3K56me1)处的单甲基化促进了与PCNA的相互作用,是DNA复制所必需的。PTM在Thr-4(H3T3ph)处在前期被HASPIN磷酸化,在后期脱磷。AURKB在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化对有丝分裂和减数分裂期间的染色体凝聚和细胞周期进程至关重要。此外,RPS6KA4和RPS6KA5在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化在间期非常重要,因为它能够在外部刺激后转录基因,如有丝分裂原、应激、生长因子或紫外线照射,并导致基因激活,如c-fos和c-jun。Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化,它与基因激活有关,阻止Lys-10(H3K9me)的甲基化,但促进H3和H4的乙酰化。AURKB在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化介导HP1蛋白(CBX1、CBX3和CBX5)与异染色质的解离。Ser-11(H3S10ph)的磷酸化也是肿瘤细胞转化的重要调节机制。丝氨酸-29(H3S28ph)在有丝分裂或紫外线B照射期间被MAP3K20亚型1、RPS6KA5或AURKB磷酸化。PRKCB在Thr-7(H3T6ph)处的磷酸化是一种表观遗传转录激活的特异性标记,可防止LSD1/KDM1A使Lys-5(H3K4me)去甲基化。在着丝粒上,通过DAPK3和PKN1在Thr-12(H3T11ph)从前期到后期早期特异性磷酸化。PKN1对Thr-12(H3T11ph)的磷酸化是一种表观遗传转录激活的特异性标记,可通过KDM4C/JMJD2C促进Lys-10(H3K9me)的去甲基化。染色质相关CHEK1在Thr-12(H3T11ph)处的磷酸化通过调节Lys-10(H3K9ac)的乙酰化来调节细胞周期调节基因的转录。JAK2在Tyr-42(H3Y41ph)处的磷酸化促进了CBX5(HP1α)从染色质中排除。在淋巴细胞中,RAG1使PTM单泛素化,V(D)J重组需要单泛素化(通过相似性)。CUL4-DDB-RBX1复合物对紫外线照射的泛素化。这可能会削弱组蛋白和DNA之间的相互作用,并促进DNA修复蛋白质的可及性。Lys-5(H3K4all)处PTM赖氨酸脱氨形成赖氨酸是由LOXL2介导的。LOXL2仅在H3K4me3和H3K4me3上形成赖氨酸results in gene repression.PTM Crotonylation (Kcr) is specifically present in male germ cells and marks testis-specific genes in post-meiotic cells, including X-linked genes that escape sex chromosome inactivation in haploid cells. Crotonylation marks active promoters and enhancers and confers resistance to transcriptional repressors. It is also associated with post-meiotically activated genes on autosomes.PTM Butyrylation of histones marks active promoters and competes with histone acetylation. It is present during late spermatogenesis.PTM Succinylation at Lys-80 (H3K79succ) by KAT2A takes place with a maximum frequency around the transcription start sites of genes (PubMed:29211711). It gives a specific tag for epigenetic transcription activation (PubMed:29211711). Desuccinylation at Lys-123 (H3K122succ) by SIRT7 in response to DNA damage promotes chromatin condensation and double-strand breaks (DSBs) repair (PubMed:27436229).PTM Serine ADP-ribosylation constitutes the primary form of ADP-ribosylation of proteins in response to DNA damage (PubMed:30257210). Serine ADP-ribosylation at Ser-11 (H3S10ADPr) is mutually exclusive with phosphorylation at Ser-11 (H3S10ph) and impairs acetylation at Lys-10 (H3K9ac) (PubMed:30257210).PTM Serotonylated by TGM2 at Gln-6 (H3Q5ser) during serotonergic neuron differentiation (PubMed:30867594). H3Q5ser is associated with trimethylation of Lys-5 (H3K4me3) and enhances general transcription factor IID (TFIID) complex-binding to H3K4me3, thereby facilitating transcription (PubMed:30867594).PTM Dopaminylated by TGM2 at Gln-6 (H3Q5dop) in ventral tegmental area (VTA) neurons (PubMed:32273471). H3Q5dop mediates neurotransmission-independent role of nuclear dopamine by regulating relapse-related transcriptional plasticity in the reward system (By similarity).PTM Lactylated in macrophages by EP300/P300 by using lactoyl-CoA directly derived from endogenous or exogenous lactate, leading to stimulates gene transcription.DISEASE HIST1H3B or HIST1H3C mutations affecting residue Lys-37 of histone H3.1 are involved in the pathogenesis of pediatric undifferentiated soft tissue sarcomas. The mechanism through which mutations lead to tumorigenesis involves altered histones methylation with gain of global H3K27 methylation, altered Polycomb repressive complex 1 (PRC1) activity, aberrant epigenetic regulation of gene expression and impaired differentiation of mesenchimal progenitor cells.MISCELLANEOUS This histone is only present in mammals and is enriched in acetylation of Lys-15 and dimethylation of Lys-10 (H3K9me2).SIMILARITY Belongs to the histone H3 family.CAUTION The original paper reporting lysine deamination at Lys-5 by LOXL2 has been retracted due to inappropriate manipulation of figure data (PubMed:22483618, PubMed:27392148). However, this modification was confirmed in a subsequent publication (PubMed:27735137). HOMO SAPIENS. NCBI分类法 9606 UniProt P68431 28 相等的 N6,N6,N6-三甲基-L-赖氨酸 摩登派青年 mod:00083. 2 相等的 136 相等的 Reactome数据库ID版本77 4754169 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=4754169 反应途径 r - hsa - 4754169 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754169.1 HIST2H3C Me3K28-HIST2H3A 组蛋白H3.2. HIST2H3D Reactome DB_ID: 4754178 UniProt: Q71DI3 H3C15 H3C15 HIST2H3A H3C14 H3F2 H3FM HIST2H3C H3C13 HIST2H3D 核小体的功能核心成分。核小体将DNA包裹并压缩到染色质中,限制DNA进入需要DNA作为模板的细胞机制。因此,组蛋白在转录调节、DNA修复、DNA复制和染色体稳定性中起着核心作用。DNA可及性通过组蛋白的一组复杂翻译后修饰(也称为组蛋白编码)和核小体重塑来调节。亚单位核小体是一种组蛋白八聚体,包含两个分子,分别为H2A、H2B、H3和H4,组装在一个H3-H4异四聚体和两个H2A-H2B异二聚体中。八聚体包裹了大约147bp的DNA。在核小体组装过程中,伴侣ASF1A与组蛋白H3-H4异二聚体相互作用。发育阶段在S期表达,然后随着分化过程中细胞分裂的减慢,表达强烈降低。PTM乙酰化通常与基因激活有关。Lys-10(H3K9ac)上的乙酰化损害Arg-9(H3R8me2s)的甲基化。Lys-19(H3K18ac)和Lys-24(H3K24ac)上的乙酰化有利于Arg-18(H3R17me)的甲基化。EP300/p300在Lys-123(H3K122ac)处的乙酰化在染色质结构中起着中心作用:定位于组蛋白八聚体表面并刺激转录,可能通过促进核小体不稳定性。精氨酸-9(H3R8ci)和/或精氨酸-18(H3R17ci)处的PTM瓜氨酸化PADI4损伤甲基化并抑制转录。CARM1在Arg-18(H3R17me2a)的PTM不对称二甲基化与基因激活有关。PRMT5在Arg-9(H3R8me2s)的对称二甲基化与基因抑制有关。PRMT6在Arg-3(H3R2me2a)处的不对称二甲基化与基因抑制有关,并与H3-Lys-5甲基化(H3K4me2和H3K4me3)相互排斥。H3R2me2a存在于基因的3'端,无论其转录状态如何,并且在非活性启动子上富集,而在活性启动子上缺失。Lys-5(H3K4me)、Lys-37(H3K36me)和Lys-80(H3K79me)的PTM甲基化与基因激活有关。Lys-5(H3K4me)的甲基化促进H3和H4的后续乙酰化。Lys-80(H3K79me)的甲基化与DNA双链断裂(DSB)反应相关,是TP53BP1的特异性靶点。Lys-10(H3K9me)和Lys-28(H3K27me)的甲基化与基因抑制有关。Lys-10(H3K9me)处的甲基化是HP1蛋白(CBX1、CBX3和CBX5)的特异性靶点,可防止随后在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化以及H3和H4的乙酰化。赖氨酸-5(H3K4me)和赖氨酸-80(H3K79me)的甲基化需要在“赖氨酸-120”处对H2B进行初步的单泛素化。Lys-10(H3K9me)和Lys-28(H3K27me)的甲基化在非活性X染色体染色质中富集。G1期EHMT2/G9A在Lys-57(H3K56me1)处的单甲基化促进了与PCNA的相互作用,是DNA复制所必需的。PTM在Thr-4(H3T3ph)处在前期被HASPIN磷酸化,在后期脱磷。AURKB在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化对有丝分裂和减数分裂期间的染色体凝聚和细胞周期进程至关重要。此外,RPS6KA4和RPS6KA5在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化在间期非常重要,因为它能够在外部刺激后转录基因,如有丝分裂原、应激、生长因子或紫外线照射,并导致基因激活,如c-fos和c-jun。Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化,它与基因激活有关,阻止Lys-10(H3K9me)的甲基化,但促进H3和H4的乙酰化。AURKB在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化介导HP1蛋白(CBX1、CBX3和CBX5)与异染色质的解离。Ser-11(H3S10ph)的磷酸化也是肿瘤细胞转化的重要调节机制。丝氨酸-29(H3S28ph)在有丝分裂或紫外线B照射期间被MAP3K20亚型1、RPS6KA5或AURKB磷酸化。PRKCB在Thr-7(H3T6ph)处的磷酸化是一种表观遗传转录激活的特异性标记,可防止LSD1/KDM1A使Lys-5(H3K4me)去甲基化。在着丝粒上,通过DAPK3和PKN1在Thr-12(H3T11ph)从前期到后期早期特异性磷酸化。PKN1对Thr-12(H3T11ph)的磷酸化是一种表观遗传转录激活的特异性标记,可通过KDM4C/JMJD2C促进Lys-10(H3K9me)的去甲基化。JAK2在Tyr-42(H3Y41ph)处的磷酸化促进CBX5(HP1α)从染色质中排除。在淋巴细胞中,RAG1对PTM单泛素化,V(D)J重组需要单泛素化。CUL4-DDB-RBX1复合物对紫外线照射的泛素化。这可能会削弱组蛋白和DNA之间的相互作用,并促进DNA修复蛋白质的可及性。Lys-5(H3K4all)处PTM赖氨酸脱氨形成赖氨酸是由LOXL2介导的。LOXL2仅在H3K4me3上形成赖氨酸并导致基因抑制。PTM巴豆酰化(Kcr)在雄性生殖细胞中特异存在and marks testis-specific genes in post-meiotic cells, including X-linked genes that escape sex chromosome inactivation in haploid cells. Crotonylation marks active promoters and enhancers and confers resistance to transcriptional repressors. It is also associated with post-meiotically activated genes on autosomes.PTM Butyrylation of histones marks active promoters and competes with histone acetylation. It is present during late spermatogenesis.PTM Succinylation at Lys-80 (H3K79succ) by KAT2A takes place with a maximum frequency around the transcription start sites of genes (PubMed:29211711). It gives a specific tag for epigenetic transcription activation (PubMed:29211711). Desuccinylation at Lys-123 (H3K122succ) by SIRT7 in response to DNA damage promotes chromatin condensation and double-strand breaks (DSBs) repair (PubMed:27436229).PTM Serine ADP-ribosylation constitutes the primary form of ADP-ribosylation of proteins in response to DNA damage (PubMed:29480802). Serine ADP-ribosylation at Ser-11 (H3S10ADPr) is mutually exclusive with phosphorylation at Ser-11 (H3S10ph) and impairs acetylation at Lys-10 (H3K9ac) (PubMed:30257210).PTM Serotonylated by TGM2 at Gln-6 (H3Q5ser) during serotonergic neuron differentiation (PubMed:30867594). H3Q5ser is associated with trimethylation of Lys-5 (H3K4me3) and enhances general transcription factor IID (TFIID) complex-binding to H3K4me3, thereby facilitating transcription (PubMed:30867594).PTM Dopaminylated by TGM2 at Gln-6 (H3Q5dop) in ventral tegmental area (VTA) neurons (PubMed:32273471). H3Q5dop mediates neurotransmission-independent role of nuclear dopamine by regulating relapse-related transcriptional plasticity in the reward system (By similarity).PTM Lactylated in macrophages by EP300/P300 by using lactoyl-CoA directly derived from endogenous or exogenous lactate, leading to stimulates gene transcription.SIMILARITY Belongs to the histone H3 family.CAUTION The original paper reporting lysine deamination at Lys-5 by LOXL2 has been retracted due to inappropriate manipulation of figure data (PubMed:22483618, PubMed:27392148). However, this modification was confirmed in a subsequent publication (PubMed:27735137). UniProt Q71DI3 28 相等的 2 相等的 136 相等的 Reactome数据库ID版本77 4754178 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=4754178 反应途径 r - hsa - 4754178 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754178.1 Reactome数据库ID版本77 5649781 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5649781 反应途径 R-HSA-5649781 1 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5649781.1 二氧化碳 二氧化碳 反应数据库ID:159942 二氧化碳(ChEBI: 16526) 二氧化碳 Chebi. 车比:16526 Reactome数据库ID版本77 159942 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=159942 反应途径 r - - 159942 3. Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-159942.3 化合物 C00011 救援 琥珀酸 琥珀酸 琥珀酸(2-) 反应数据库ID:159939 琥珀酸盐(2-)[ChEBI:30031] 琥珀酸(2-) (-) OOC-CH2-CH2-COO (-) 琥珀酸盐 丁二酸,离子(2 -) 丁二酸酯 Chebi. CHEBI: 30031 Reactome数据库ID版本77 159939 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=159939 反应途径 r-all-159939 5 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-all-159939.5 化合物 C00042 CH2O. 甲醛 甲醛 Oxomethane Oxomethylene 氧化亚甲基 反应DB_ID:29478 甲醛(ChEBI: 16842) 甲醛 Chebi. Chebi:16842 Reactome数据库ID版本77 29478 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29478 反应途径 R-ALL-29478 3. 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29478.3 化合物 C00067. 从反垃圾中的EntitySet转换 Me2K28组蛋白H3 Me2K28-复制组蛋白H3 ME2K28-Replication依赖的组蛋白H3 Me2K28-HIST1H3A,Me2K28-HIST2H3A 反应DB_ID:5649790 HIST1H3A me2k28-hist1h3a h31_human. 反应DB_ID:4754193 28 相等的 N6, N6-dimethyl-L-lysine 摩登派青年 mod:00084. 2 相等的 136 相等的 Reactome数据库ID版本77 4754193 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=4754193 反应途径 r - hsa - 4754193 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754193.1 HIST2H3C Me2K28-HIST2H3A 组蛋白H3.2. HIST2H3D 反应DB_ID:4754197 28 相等的 2 相等的 136 相等的 Reactome数据库ID版本77 4754197 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=4754197 反应途径 R-HSA-4754197 1 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754197.1 Reactome数据库ID版本77 5649790 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5649790 反应途径 R-HSA-5649790 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5649790.1 激活 从反垃圾中的EntitySet转换 KDM6A、KDM6B KDM6C KDM7A 反应数据库ID:4754234 KDM6A 赖氨酸特异性去甲基化酶6A ecNumber1.14.11.-/ecNumber KDM6A_HUMAN 反应数据库ID:4754224 UniProt:O15550 KDM6A KDM6A UTX. 功能组蛋白脱甲基酶,其特异性地去甲基化组蛋白H3的“Lys-27”,从而在组蛋白代码中发挥着中心作用(PubMed:17851529,PubMed:17713478,PubMed:17761849)。将甲基化物甲基化物和二甲基化但不是单甲基化的H3'LYS-27'(PUBMED:17851529,PUBMED:17713478,PUBMED:17761849)。通过调节Hox基因表达(PubMed:17851529),在后验开发的调节中起着核心作用。组蛋白H3的“Lys-27”的去甲基化是伴随组蛋白H3的“Lys-4”的甲基化,并调节组络合物的募集组蛋白H2A(PubMed:17761849)。在染色蛋白重塑中起脱甲基酶独立作用以调节T盒家族成员依赖性基因表达(通过相似性).Subunit与TLE1(相似性)相互作用。MLL2 / 3复数的组件(也命名为ASCOM复杂),至少由KMT2D / MLL2或KMT2C / MLL3,ASH2L,RBBP5,WDR5,NCOA6,DPY30,KDM6A(或KDM6B),PAXIP1 / PTIP,PTAG1和ALPHA-和β-小蛋白(PubMed:17500065,PubMed:17713478)。与supt6h互动。与smarca4(按照相似性相互作用.Miscellauntions逃离X染色体失活。灵活属于UTX系列。 UniProt O15550 1 相等的 1401. 相等的 Reactome数据库ID版本77 4754224 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=4754224 反应途径 R-HSA-4754224 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-4754224.1 KDM6B. 赖氨酸特异性去甲基酶6B JMJD3 JMJC含域的蛋白质3 含Jumonji含域的蛋白质3 赖氨酸脱甲基酶6B KIAA0346 反应DB_ID:1629833 UNIPROT:O15054 KDM6B KDM6B. JMJD3 KIAA0346 功能组蛋白去甲基化酶,特异性去甲基化组蛋白H3的“Lys-27”,从而在组蛋白编码中发挥中心作用(PubMed:17825402,PubMed:17851529,PubMed:17713478,PubMed:18003914)。去甲基化和二甲基化H3‘Lys-27’(PubMed:17825402,PubMed:17851529,PubMed:17713478,PubMed:18003914)。通过调节HOX基因表达,在后发育调节中发挥中心作用(PubMed:17851529)。在炎症情况下,通过调节基因表达和巨噬细胞分化参与巨噬细胞分化,参与炎症反应(PubMed:17825402)。在染色质重塑中发挥非甲基化酶的作用,通过充当T-box因子和含有SMARCA4的SWI/SNF重塑复合物(通过相似性)之间的联系来调节T-box家族成员依赖性基因表达。亚单位与TLE1相互作用(通过相似性)。MLL4复合物的组分,至少由KMT2B/MLL4、ASH2L、RBBP5、WDR5和KDM6B组成(PubMed:17825402)。与TBX21、SMARC4、SMARCC1和SMARCC2相互作用(通过相似性)。12-O-十四烷基佛波醇-13-乙酸酯(TPA)在髓系白血病细胞中的诱导。相似性属于UTX家族。 UniProt O15054 1 相等的 1643. 相等的 Reactome数据库ID版本77 1629833 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1629833 反应途径 r - hsa - 1629833 1 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1629833.1 乌蒂 KDM6C. 组蛋白去甲基酶UTY 乌蒂尤人 反应DB_ID:8849395 UniProt: O14607 UTY 乌蒂 KDM6C. 功能:对组蛋白H3中的三甲基化“Lys-27”(H3K27me3)去甲基化进行催化的雄性特异性组蛋白去甲基酶。具有相对较低的赖氨酸脱甲基酶活性。亚基与TLE1和TLE2相互作用。相似性属于UTX家族。 UniProt O14607. 1 相等的 1347 相等的 Reactome数据库ID版本77 8849395 数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8849395 反应途径 R-HSA-8849395 1 Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-8849395.1 kdm7a. 赖氨酸特异性去甲基酶7a Ecnumber1.14.11 .- / ecnumber KDM7A_人 Reactome DB_ID: 5423088 UniProt: Q6ZMT4 KDM7A kdm7a. JHDM1D KDM7 KIAA1718 大脑发育所需的组蛋白去甲基化酶。具体的去甲基化组蛋白H3的二甲基化'Lys-9'和'Lys-27'(分别为H3K9me2和H3K27me2)和组蛋白H4 'Lys-20'单甲基化残基(H4K20Me1),从而在组蛋白编码中起核心作用。特异性结合组蛋白H3 (H3K4me3)的三甲基化'Lys-4',影响组蛋白去甲基化酶的特异性:在H3K4me3存在时,对H3K9me2没有去甲基化酶活性,而对H3K27me2有较高的活性。在没有H3K4me3的情况下去甲基化H3K9me2。只有当核小体作为底物而非组蛋白八聚体作为底物时,才对H4K20Me1有活性。phd型锌指介导与H3K4me3的结合。与H3K4me3结合阻止其访问H3K9me2。连接子区域是去甲基化酶特异性的关键决定因素。当PHD-type zinc finger与H3K4me3结合时,阻止JmjC活性位点到达靶点H3K9me2,而对H3K27me2具有选择性。属于JHDM1组蛋白去甲基化酶家族。JHDM1D亚科。 UniProt Q6ZMT4 1 相等的 941 相等的 Reactome数据库ID版本77 5423088 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=5423088 反应途径 R-HSA-5423088 1 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5423088.1 Reactome数据库ID版本77 4754234 数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=4754234 反应途径 R-HSA-4754234 2 反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754234.2 基因本体论 GO:0032452 细胞功能的基因本体论术语 MI. 小姐:0355 相同的催化剂活性 Reactome数据库ID版本77 4754232 数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=4754232 Reactome数据库ID版本77 5661121. 数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=5661121 反应途径 R-HSA-5661121 2 Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5661121.2 24798337 Pubmed 2014 人类的UTY(KDM6C)是一种雄性特异性N1μ-甲基溶酶脱甲基酶 沃尔波特,路易斯j Hopkinson,Richard J Vollmar,Melanie. 莎拉·K·麦登 基列迪,卡琳娜 奥珀曼,美国 Schofield,Christopher J 约翰逊,汀草林 比奥。化学。289:18302-13 17825402 Pubmed 2007 组蛋白H3赖氨酸-27脱甲基酶JMJD3将炎症与抑制抑制作用抑制多元菌介导的基因沉默 De Santa,Francesca 托塔罗,玛丽亚·格拉齐亚 Prosperini,埃琳娜 NOTARBARTOLO,SAMUERE. 外种皮,朱塞佩 Natoli, Gioacchino 单元格130:1083-94 20023638. Pubmed 2010 jumonji组蛋白赖氨酸赖氨酸赖氨酸脱嘌呤酶系列底物特异性的酶和结构见解 Horton,John R Upadhyay,Anup K 齐汉克 张,兴 史,杨 程,小东 Nat。结构。17:38-43摩尔。杂志 17851529 Pubmed 2007 组蛋白H3赖氨酸27脱甲基酶调节动物后部发展 局域网,范 Bayliss彼得E Rinn,约翰L 鲸鱼,约翰坦r 王,可要K 陈,朱淑真 IWase,Shigeki. alpatov,罗马 Issaeva,Irina Canaani,Eli. 罗伯茨,托马斯米 张,重 史,杨 自然449:689-94 17713478 Pubmed 2007 UTX和JMJD3是参与HOX基因调控和发育的组蛋白H3K27去甲基化酶 阿格尔,卡尔 克鲁斯,保罗 克里斯坦森,Jesper 帕西尼,迭戈 罗斯,西蒙 拉普斯伯伯,汝人 Issaeva,Irina Canaani,Eli. 安娜,Salcini伊丽莎白。 海伦,克里斯蒂安 自然449:731-4 17761849 Pubmed 2007 H3K27的去甲基化调节多梳募集和H2A泛素化 Lee Min光宇 别墅,Raffaella Trojer,Patrick. 诺曼,杰西卡 颜凯平 Reinberg,丹尼 Di Croce,Luciano Shiekhattar,拉蒙 科学318:447-50 17500065 Pubmed 2007 PTIP与含有MLL3-和mll4的组蛋白H3赖氨酸4甲基转移酶复合物结合 町,年轻的衣服 洪,特雷萨 洪顺华 郭,洪 俞,洪 金,爸爸 Guszczynski,泰德 杜丝勒,格雷戈里·R 特里·D·科普兰 Kalkum,Markus. 葛,凯 比奥。化学。282:20395-406 20084082. Pubmed 2010 双特异性组蛋白去甲基化酶KIAA1718 (KDM7A)通过FGF4调控神经分化 黄阳黄阳 湘,杨 王,yanru 李,夏 徐,龙永 朱子琪 张,婷 朱庆庆 张克静 景乃和 陈,查理德贵 细胞res。20:154-65