从“KDM6A,KDM6B,KDM7A去甲基化物ME3K28-MEDONE H3”转换为BIOPAX途径在反应数据库中。
从左到右
KDM6A、KDM6B、KDM7A使Me3K28组蛋白H3去甲基化
除KDM1A外,所有具有特征的赖氨酸去甲基酶都属于jumonjiC结构域(JmjC)包含家族。JmjC kdm是单核Fe (II)依赖加氧酶Cupin超家族的成员,其特征是存在双链β -螺旋核心折叠。JmjC kdm需要2个氧戊二酸(2 OG)和分子氧作为共底物,与甲醛、琥珀酸和二氧化碳一起产生。这种基于羟基化的机制不需要质子化的赖氨酸胺基,因此含有去甲基酶的JmjC能够去甲基三、二和单甲基赖氨酸。< br > KDM6A (UTX) KDM6B (JMJD3) KDM6C (UTY)和KDM7A (JHDM1D)催化的脱甲基di或tri-methylated lysine-28的组蛋白H3 (H3K27Me2/3)(阿格et al . 2007年,赵等。2007年,德Santra等。2007年,香港et al . 2007年,局域网等。2007年,李等人。2007年,霍顿et al . 2010年,黄光裕等人。2010年,Walport et al . 2014年)。
撰写:jupe,s,2013-03-12
审查:斯科菲尔德,克里斯托弗J,2014-05-08
审查:路易丝沃尔波特,2014-05-08
评论:Hopkinson, Richard, 2014-05-08
编辑:朱佩,S,2014-02-05
2
2-Oxoglutarate.
2-酮戊二酸
alpha-ketoglutarate
反应DB_ID:113671
骨髓
基因本体论
GO:0005654
2-氧代流(2-)[Chebi:16810]
2-oxoglutarate (2 -)
2- ketoglutarate.
alpha-ketoglutarate
2-氧代戊烷二酸,离子(2-)
2-Oxoglutarate.
Chebi.
CHEBI: 16810
Reactome数据库ID版本77
113671
数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=113671
反应途径
R-ALL-113671
4
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113671.4
反应途径
http://www.reacectome.org.
化合物
C00026.
额外的信息
MI.
MI:0361
O2
氧气
氧气
反应DB_ID:113685
分子氧(ChEBI: 15379)
氧气
Chebi.
Chebi:15379
Reactome数据库ID版本77
113685
数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=113685
反应途径
r-all-113685
3.
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-113685.3
化合物
C00007
从反垃圾中的EntitySet转换
ME3K28-组蛋白H3
Me3K28-replicative组蛋白H3
ME3K28-复制依赖性组蛋白H3
ME3K28-HIST1H3A,ME3K28-HIST2H3A
反弹DB_ID:5649781
HIST1H3A
Me3K28-HIST1H3A
h31_human.
Reactome DB_ID: 4754169
UNIPROT:P68431 H3C1
H3C1
H3FA
HIST1H3A
H3C2
H3FL
HIST1H3B
H3C3
h3fchist1h3c.
H3C4
H3FB
HIST1H3D
H3C6
H3FD
HIST1H3E
H3C7
H3FI
HIST1H3F
H3C8
H3FH
HIST1H3G
H3C10
H3FK
HIST1H3H
H3C11
H3FF
HIST1H3I
H3C12
H3FJ
HIST1H3J
核小体的功能核心成分。核小体将DNA包裹并压缩到染色质中,限制DNA进入需要DNA作为模板的细胞机制。因此,组蛋白在转录调节、DNA修复、DNA复制和染色体稳定性中起着核心作用。DNA可及性通过组蛋白的一组复杂翻译后修饰(也称为组蛋白编码)和核小体重塑来调节。亚单位核小体是一种组蛋白八聚体,包含两个分子,分别为H2A、H2B、H3和H4,组装在一个H3-H4异四聚体和两个H2A-H2B异二聚体中。八聚体包裹了约147 bp的DNA。发育阶段在S期表达,然后在分化过程中随着细胞分裂的减慢表达强烈降低。PTM乙酰化通常与基因激活有关。Lys-10(H3K9ac)上的乙酰化损害Arg-9(H3R8me2s)的甲基化。Lys-19(H3K18ac)和Lys-24(H3K24ac)上的乙酰化有利于Arg-18(H3R17me)的甲基化。EP300/p300在Lys-123(H3K122ac)处的乙酰化在染色质结构中起着中心作用:定位于组蛋白八聚体表面并刺激转录,可能通过促进核小体不稳定性。精氨酸-9(H3R8ci)和/或精氨酸-18(H3R17ci)处的PTM瓜氨酸化PADI4损伤甲基化并抑制转录。CARM1在Arg-18(H3R17me2a)的PTM不对称二甲基化与基因激活有关。PRMT5在Arg-9(H3R8me2s)的对称二甲基化与基因抑制有关。PRMT6在Arg-3(H3R2me2a)处的不对称二甲基化与基因抑制有关,并与H3-Lys-5甲基化(H3K4me2和H3K4me3)相互排斥。H3R2me2a存在于基因的3'端,无论其转录状态如何,并且在非活性启动子上富集,而在活性启动子上缺失。Lys-5(H3K4me)、Lys-37(H3K36me)和Lys-80(H3K79me)的PTM甲基化与基因激活有关。Lys-5(H3K4me)的甲基化促进H3和H4的后续乙酰化。Lys-80(H3K79me)的甲基化与DNA双链断裂(DSB)反应相关,是TP53BP1的特异性靶点。Lys-10(H3K9me)和Lys-28(H3K27me)的甲基化与基因抑制有关。Lys-10(H3K9me)处的甲基化是HP1蛋白(CBX1、CBX3和CBX5)的特异性靶点,可防止随后在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化以及H3和H4的乙酰化。赖氨酸-5(H3K4me)和赖氨酸-80(H3K79me)的甲基化需要在“赖氨酸-120”处对H2B进行初步的单泛素化。Lys-10(H3K9me)和Lys-28(H3K27me)的甲基化在非活性X染色体染色质中富集。G1期EHMT2/G9A在Lys-57(H3K56me1)处的单甲基化促进了与PCNA的相互作用,是DNA复制所必需的。PTM在Thr-4(H3T3ph)处在前期被HASPIN磷酸化,在后期脱磷。AURKB在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化对有丝分裂和减数分裂期间的染色体凝聚和细胞周期进程至关重要。此外,RPS6KA4和RPS6KA5在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化在间期非常重要,因为它能够在外部刺激后转录基因,如有丝分裂原、应激、生长因子或紫外线照射,并导致基因激活,如c-fos和c-jun。Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化,它与基因激活有关,阻止Lys-10(H3K9me)的甲基化,但促进H3和H4的乙酰化。AURKB在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化介导HP1蛋白(CBX1、CBX3和CBX5)与异染色质的解离。Ser-11(H3S10ph)的磷酸化也是肿瘤细胞转化的重要调节机制。丝氨酸-29(H3S28ph)在有丝分裂或紫外线B照射期间被MAP3K20亚型1、RPS6KA5或AURKB磷酸化。PRKCB在Thr-7(H3T6ph)处的磷酸化是一种表观遗传转录激活的特异性标记,可防止LSD1/KDM1A使Lys-5(H3K4me)去甲基化。在着丝粒上,通过DAPK3和PKN1在Thr-12(H3T11ph)从前期到后期早期特异性磷酸化。PKN1对Thr-12(H3T11ph)的磷酸化是一种表观遗传转录激活的特异性标记,可通过KDM4C/JMJD2C促进Lys-10(H3K9me)的去甲基化。染色质相关CHEK1在Thr-12(H3T11ph)处的磷酸化通过调节Lys-10(H3K9ac)的乙酰化来调节细胞周期调节基因的转录。JAK2在Tyr-42(H3Y41ph)处的磷酸化促进了CBX5(HP1α)从染色质中排除。在淋巴细胞中,RAG1使PTM单泛素化,V(D)J重组需要单泛素化(通过相似性)。CUL4-DDB-RBX1复合物对紫外线照射的泛素化。这可能会削弱组蛋白和DNA之间的相互作用,并促进DNA修复蛋白质的可及性。Lys-5(H3K4all)处PTM赖氨酸脱氨形成赖氨酸是由LOXL2介导的。LOXL2仅在H3K4me3和H3K4me3上形成赖氨酸results in gene repression.PTM Crotonylation (Kcr) is specifically present in male germ cells and marks testis-specific genes in post-meiotic cells, including X-linked genes that escape sex chromosome inactivation in haploid cells. Crotonylation marks active promoters and enhancers and confers resistance to transcriptional repressors. It is also associated with post-meiotically activated genes on autosomes.PTM Butyrylation of histones marks active promoters and competes with histone acetylation. It is present during late spermatogenesis.PTM Succinylation at Lys-80 (H3K79succ) by KAT2A takes place with a maximum frequency around the transcription start sites of genes (PubMed:29211711). It gives a specific tag for epigenetic transcription activation (PubMed:29211711). Desuccinylation at Lys-123 (H3K122succ) by SIRT7 in response to DNA damage promotes chromatin condensation and double-strand breaks (DSBs) repair (PubMed:27436229).PTM Serine ADP-ribosylation constitutes the primary form of ADP-ribosylation of proteins in response to DNA damage (PubMed:30257210). Serine ADP-ribosylation at Ser-11 (H3S10ADPr) is mutually exclusive with phosphorylation at Ser-11 (H3S10ph) and impairs acetylation at Lys-10 (H3K9ac) (PubMed:30257210).PTM Serotonylated by TGM2 at Gln-6 (H3Q5ser) during serotonergic neuron differentiation (PubMed:30867594). H3Q5ser is associated with trimethylation of Lys-5 (H3K4me3) and enhances general transcription factor IID (TFIID) complex-binding to H3K4me3, thereby facilitating transcription (PubMed:30867594).PTM Dopaminylated by TGM2 at Gln-6 (H3Q5dop) in ventral tegmental area (VTA) neurons (PubMed:32273471). H3Q5dop mediates neurotransmission-independent role of nuclear dopamine by regulating relapse-related transcriptional plasticity in the reward system (By similarity).PTM Lactylated in macrophages by EP300/P300 by using lactoyl-CoA directly derived from endogenous or exogenous lactate, leading to stimulates gene transcription.DISEASE HIST1H3B or HIST1H3C mutations affecting residue Lys-37 of histone H3.1 are involved in the pathogenesis of pediatric undifferentiated soft tissue sarcomas. The mechanism through which mutations lead to tumorigenesis involves altered histones methylation with gain of global H3K27 methylation, altered Polycomb repressive complex 1 (PRC1) activity, aberrant epigenetic regulation of gene expression and impaired differentiation of mesenchimal progenitor cells.MISCELLANEOUS This histone is only present in mammals and is enriched in acetylation of Lys-15 and dimethylation of Lys-10 (H3K9me2).SIMILARITY Belongs to the histone H3 family.CAUTION The original paper reporting lysine deamination at Lys-5 by LOXL2 has been retracted due to inappropriate manipulation of figure data (PubMed:22483618, PubMed:27392148). However, this modification was confirmed in a subsequent publication (PubMed:27735137).
HOMO SAPIENS.
NCBI分类法
9606
UniProt
P68431
28
相等的
N6,N6,N6-三甲基-L-赖氨酸
摩登派青年
mod:00083.
2
相等的
136
相等的
Reactome数据库ID版本77
4754169
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=4754169
反应途径
r - hsa - 4754169
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754169.1
HIST2H3C
Me3K28-HIST2H3A
组蛋白H3.2.
HIST2H3D
Reactome DB_ID: 4754178
UniProt: Q71DI3 H3C15
H3C15
HIST2H3A
H3C14
H3F2
H3FM
HIST2H3C
H3C13
HIST2H3D
核小体的功能核心成分。核小体将DNA包裹并压缩到染色质中,限制DNA进入需要DNA作为模板的细胞机制。因此,组蛋白在转录调节、DNA修复、DNA复制和染色体稳定性中起着核心作用。DNA可及性通过组蛋白的一组复杂翻译后修饰(也称为组蛋白编码)和核小体重塑来调节。亚单位核小体是一种组蛋白八聚体,包含两个分子,分别为H2A、H2B、H3和H4,组装在一个H3-H4异四聚体和两个H2A-H2B异二聚体中。八聚体包裹了大约147bp的DNA。在核小体组装过程中,伴侣ASF1A与组蛋白H3-H4异二聚体相互作用。发育阶段在S期表达,然后随着分化过程中细胞分裂的减慢,表达强烈降低。PTM乙酰化通常与基因激活有关。Lys-10(H3K9ac)上的乙酰化损害Arg-9(H3R8me2s)的甲基化。Lys-19(H3K18ac)和Lys-24(H3K24ac)上的乙酰化有利于Arg-18(H3R17me)的甲基化。EP300/p300在Lys-123(H3K122ac)处的乙酰化在染色质结构中起着中心作用:定位于组蛋白八聚体表面并刺激转录,可能通过促进核小体不稳定性。精氨酸-9(H3R8ci)和/或精氨酸-18(H3R17ci)处的PTM瓜氨酸化PADI4损伤甲基化并抑制转录。CARM1在Arg-18(H3R17me2a)的PTM不对称二甲基化与基因激活有关。PRMT5在Arg-9(H3R8me2s)的对称二甲基化与基因抑制有关。PRMT6在Arg-3(H3R2me2a)处的不对称二甲基化与基因抑制有关,并与H3-Lys-5甲基化(H3K4me2和H3K4me3)相互排斥。H3R2me2a存在于基因的3'端,无论其转录状态如何,并且在非活性启动子上富集,而在活性启动子上缺失。Lys-5(H3K4me)、Lys-37(H3K36me)和Lys-80(H3K79me)的PTM甲基化与基因激活有关。Lys-5(H3K4me)的甲基化促进H3和H4的后续乙酰化。Lys-80(H3K79me)的甲基化与DNA双链断裂(DSB)反应相关,是TP53BP1的特异性靶点。Lys-10(H3K9me)和Lys-28(H3K27me)的甲基化与基因抑制有关。Lys-10(H3K9me)处的甲基化是HP1蛋白(CBX1、CBX3和CBX5)的特异性靶点,可防止随后在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化以及H3和H4的乙酰化。赖氨酸-5(H3K4me)和赖氨酸-80(H3K79me)的甲基化需要在“赖氨酸-120”处对H2B进行初步的单泛素化。Lys-10(H3K9me)和Lys-28(H3K27me)的甲基化在非活性X染色体染色质中富集。G1期EHMT2/G9A在Lys-57(H3K56me1)处的单甲基化促进了与PCNA的相互作用,是DNA复制所必需的。PTM在Thr-4(H3T3ph)处在前期被HASPIN磷酸化,在后期脱磷。AURKB在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化对有丝分裂和减数分裂期间的染色体凝聚和细胞周期进程至关重要。此外,RPS6KA4和RPS6KA5在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化在间期非常重要,因为它能够在外部刺激后转录基因,如有丝分裂原、应激、生长因子或紫外线照射,并导致基因激活,如c-fos和c-jun。Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化,它与基因激活有关,阻止Lys-10(H3K9me)的甲基化,但促进H3和H4的乙酰化。AURKB在Ser-11(H3S10ph)处的磷酸化介导HP1蛋白(CBX1、CBX3和CBX5)与异染色质的解离。Ser-11(H3S10ph)的磷酸化也是肿瘤细胞转化的重要调节机制。丝氨酸-29(H3S28ph)在有丝分裂或紫外线B照射期间被MAP3K20亚型1、RPS6KA5或AURKB磷酸化。PRKCB在Thr-7(H3T6ph)处的磷酸化是一种表观遗传转录激活的特异性标记,可防止LSD1/KDM1A使Lys-5(H3K4me)去甲基化。在着丝粒上,通过DAPK3和PKN1在Thr-12(H3T11ph)从前期到后期早期特异性磷酸化。PKN1对Thr-12(H3T11ph)的磷酸化是一种表观遗传转录激活的特异性标记,可通过KDM4C/JMJD2C促进Lys-10(H3K9me)的去甲基化。JAK2在Tyr-42(H3Y41ph)处的磷酸化促进CBX5(HP1α)从染色质中排除。在淋巴细胞中,RAG1对PTM单泛素化,V(D)J重组需要单泛素化。CUL4-DDB-RBX1复合物对紫外线照射的泛素化。这可能会削弱组蛋白和DNA之间的相互作用,并促进DNA修复蛋白质的可及性。Lys-5(H3K4all)处PTM赖氨酸脱氨形成赖氨酸是由LOXL2介导的。LOXL2仅在H3K4me3上形成赖氨酸并导致基因抑制。PTM巴豆酰化(Kcr)在雄性生殖细胞中特异存在and marks testis-specific genes in post-meiotic cells, including X-linked genes that escape sex chromosome inactivation in haploid cells. Crotonylation marks active promoters and enhancers and confers resistance to transcriptional repressors. It is also associated with post-meiotically activated genes on autosomes.PTM Butyrylation of histones marks active promoters and competes with histone acetylation. It is present during late spermatogenesis.PTM Succinylation at Lys-80 (H3K79succ) by KAT2A takes place with a maximum frequency around the transcription start sites of genes (PubMed:29211711). It gives a specific tag for epigenetic transcription activation (PubMed:29211711). Desuccinylation at Lys-123 (H3K122succ) by SIRT7 in response to DNA damage promotes chromatin condensation and double-strand breaks (DSBs) repair (PubMed:27436229).PTM Serine ADP-ribosylation constitutes the primary form of ADP-ribosylation of proteins in response to DNA damage (PubMed:29480802). Serine ADP-ribosylation at Ser-11 (H3S10ADPr) is mutually exclusive with phosphorylation at Ser-11 (H3S10ph) and impairs acetylation at Lys-10 (H3K9ac) (PubMed:30257210).PTM Serotonylated by TGM2 at Gln-6 (H3Q5ser) during serotonergic neuron differentiation (PubMed:30867594). H3Q5ser is associated with trimethylation of Lys-5 (H3K4me3) and enhances general transcription factor IID (TFIID) complex-binding to H3K4me3, thereby facilitating transcription (PubMed:30867594).PTM Dopaminylated by TGM2 at Gln-6 (H3Q5dop) in ventral tegmental area (VTA) neurons (PubMed:32273471). H3Q5dop mediates neurotransmission-independent role of nuclear dopamine by regulating relapse-related transcriptional plasticity in the reward system (By similarity).PTM Lactylated in macrophages by EP300/P300 by using lactoyl-CoA directly derived from endogenous or exogenous lactate, leading to stimulates gene transcription.SIMILARITY Belongs to the histone H3 family.CAUTION The original paper reporting lysine deamination at Lys-5 by LOXL2 has been retracted due to inappropriate manipulation of figure data (PubMed:22483618, PubMed:27392148). However, this modification was confirmed in a subsequent publication (PubMed:27735137).
UniProt
Q71DI3
28
相等的
2
相等的
136
相等的
Reactome数据库ID版本77
4754178
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=4754178
反应途径
r - hsa - 4754178
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754178.1
Reactome数据库ID版本77
5649781
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5649781
反应途径
R-HSA-5649781
1
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5649781.1
二氧化碳
二氧化碳
反应数据库ID:159942
二氧化碳(ChEBI: 16526)
二氧化碳
Chebi.
车比:16526
Reactome数据库ID版本77
159942
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=159942
反应途径
r - - 159942
3.
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-159942.3
化合物
C00011
救援
琥珀酸
琥珀酸
琥珀酸(2-)
反应数据库ID:159939
琥珀酸盐(2-)[ChEBI:30031]
琥珀酸(2-)
(-) OOC-CH2-CH2-COO (-)
琥珀酸盐
丁二酸,离子(2 -)
丁二酸酯
Chebi.
CHEBI: 30031
Reactome数据库ID版本77
159939
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=159939
反应途径
r-all-159939
5
Reactome稳定的标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-all-159939.5
化合物
C00042
CH2O.
甲醛
甲醛
Oxomethane
Oxomethylene
氧化亚甲基
反应DB_ID:29478
甲醛(ChEBI: 16842)
甲醛
Chebi.
Chebi:16842
Reactome数据库ID版本77
29478
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=29478
反应途径
R-ALL-29478
3.
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-ALL-29478.3
化合物
C00067.
从反垃圾中的EntitySet转换
Me2K28组蛋白H3
Me2K28-复制组蛋白H3
ME2K28-Replication依赖的组蛋白H3
Me2K28-HIST1H3A,Me2K28-HIST2H3A
反应DB_ID:5649790
HIST1H3A
me2k28-hist1h3a
h31_human.
反应DB_ID:4754193
28
相等的
N6, N6-dimethyl-L-lysine
摩登派青年
mod:00084.
2
相等的
136
相等的
Reactome数据库ID版本77
4754193
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=4754193
反应途径
r - hsa - 4754193
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754193.1
HIST2H3C
Me2K28-HIST2H3A
组蛋白H3.2.
HIST2H3D
反应DB_ID:4754197
28
相等的
2
相等的
136
相等的
Reactome数据库ID版本77
4754197
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=4754197
反应途径
R-HSA-4754197
1
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754197.1
Reactome数据库ID版本77
5649790
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=5649790
反应途径
R-HSA-5649790
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5649790.1
激活
从反垃圾中的EntitySet转换
KDM6A、KDM6B KDM6C KDM7A
反应数据库ID:4754234
KDM6A
赖氨酸特异性去甲基化酶6A ecNumber1.14.11.-/ecNumber
KDM6A_HUMAN
反应数据库ID:4754224
UniProt:O15550 KDM6A
KDM6A
UTX.
功能组蛋白脱甲基酶,其特异性地去甲基化组蛋白H3的“Lys-27”,从而在组蛋白代码中发挥着中心作用(PubMed:17851529,PubMed:17713478,PubMed:17761849)。将甲基化物甲基化物和二甲基化但不是单甲基化的H3'LYS-27'(PUBMED:17851529,PUBMED:17713478,PUBMED:17761849)。通过调节Hox基因表达(PubMed:17851529),在后验开发的调节中起着核心作用。组蛋白H3的“Lys-27”的去甲基化是伴随组蛋白H3的“Lys-4”的甲基化,并调节组络合物的募集组蛋白H2A(PubMed:17761849)。在染色蛋白重塑中起脱甲基酶独立作用以调节T盒家族成员依赖性基因表达(通过相似性).Subunit与TLE1(相似性)相互作用。MLL2 / 3复数的组件(也命名为ASCOM复杂),至少由KMT2D / MLL2或KMT2C / MLL3,ASH2L,RBBP5,WDR5,NCOA6,DPY30,KDM6A(或KDM6B),PAXIP1 / PTIP,PTAG1和ALPHA-和β-小蛋白(PubMed:17500065,PubMed:17713478)。与supt6h互动。与smarca4(按照相似性相互作用.Miscellauntions逃离X染色体失活。灵活属于UTX系列。
UniProt
O15550
1
相等的
1401.
相等的
Reactome数据库ID版本77
4754224
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=4754224
反应途径
R-HSA-4754224
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL在反垃圾中连接到此实例的网页:http://www.reacectome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-4754224.1
KDM6B.
赖氨酸特异性去甲基酶6B
JMJD3
JMJC含域的蛋白质3
含Jumonji含域的蛋白质3
赖氨酸脱甲基酶6B
KIAA0346
反应DB_ID:1629833
UNIPROT:O15054 KDM6B
KDM6B.
JMJD3
KIAA0346
功能组蛋白去甲基化酶,特异性去甲基化组蛋白H3的“Lys-27”,从而在组蛋白编码中发挥中心作用(PubMed:17825402,PubMed:17851529,PubMed:17713478,PubMed:18003914)。去甲基化和二甲基化H3‘Lys-27’(PubMed:17825402,PubMed:17851529,PubMed:17713478,PubMed:18003914)。通过调节HOX基因表达,在后发育调节中发挥中心作用(PubMed:17851529)。在炎症情况下,通过调节基因表达和巨噬细胞分化参与巨噬细胞分化,参与炎症反应(PubMed:17825402)。在染色质重塑中发挥非甲基化酶的作用,通过充当T-box因子和含有SMARCA4的SWI/SNF重塑复合物(通过相似性)之间的联系来调节T-box家族成员依赖性基因表达。亚单位与TLE1相互作用(通过相似性)。MLL4复合物的组分,至少由KMT2B/MLL4、ASH2L、RBBP5、WDR5和KDM6B组成(PubMed:17825402)。与TBX21、SMARC4、SMARCC1和SMARCC2相互作用(通过相似性)。12-O-十四烷基佛波醇-13-乙酸酯(TPA)在髓系白血病细胞中的诱导。相似性属于UTX家族。
UniProt
O15054
1
相等的
1643.
相等的
Reactome数据库ID版本77
1629833
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=1629833
反应途径
r - hsa - 1629833
1
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-1629833.1
乌蒂
KDM6C.
组蛋白去甲基酶UTY
乌蒂尤人
反应DB_ID:8849395
UniProt: O14607 UTY
乌蒂
KDM6C.
功能:对组蛋白H3中的三甲基化“Lys-27”(H3K27me3)去甲基化进行催化的雄性特异性组蛋白去甲基酶。具有相对较低的赖氨酸脱甲基酶活性。亚基与TLE1和TLE2相互作用。相似性属于UTX家族。
UniProt
O14607.
1
相等的
1347
相等的
Reactome数据库ID版本77
8849395
数据库标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser?DB=gk_current&ID=8849395
反应途径
R-HSA-8849395
1
Reactome稳定的标识符。使用此URL将此实例的网页连接到反乐中:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser_st_id?st_id=r-hsa-8849395.1
kdm7a.
赖氨酸特异性去甲基酶7a Ecnumber1.14.11 .- / ecnumber
KDM7A_人
Reactome DB_ID: 5423088
UniProt: Q6ZMT4 KDM7A
kdm7a.
JHDM1D
KDM7
KIAA1718
大脑发育所需的组蛋白去甲基化酶。具体的去甲基化组蛋白H3的二甲基化'Lys-9'和'Lys-27'(分别为H3K9me2和H3K27me2)和组蛋白H4 'Lys-20'单甲基化残基(H4K20Me1),从而在组蛋白编码中起核心作用。特异性结合组蛋白H3 (H3K4me3)的三甲基化'Lys-4',影响组蛋白去甲基化酶的特异性:在H3K4me3存在时,对H3K9me2没有去甲基化酶活性,而对H3K27me2有较高的活性。在没有H3K4me3的情况下去甲基化H3K9me2。只有当核小体作为底物而非组蛋白八聚体作为底物时,才对H4K20Me1有活性。phd型锌指介导与H3K4me3的结合。与H3K4me3结合阻止其访问H3K9me2。连接子区域是去甲基化酶特异性的关键决定因素。当PHD-type zinc finger与H3K4me3结合时,阻止JmjC活性位点到达靶点H3K9me2,而对H3K27me2具有选择性。属于JHDM1组蛋白去甲基化酶家族。JHDM1D亚科。
UniProt
Q6ZMT4
1
相等的
941
相等的
Reactome数据库ID版本77
5423088
数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=5423088
反应途径
R-HSA-5423088
1
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Reactome数据库ID版本77
4754234
数据库标识符。使用此URL将此实例的Web页面连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=4754234
反应途径
R-HSA-4754234
2
反应稳定标识符。使用此URL连接到Reactome中此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-4754234.2
基因本体论
GO:0032452
细胞功能的基因本体论术语
MI.
小姐:0355
相同的催化剂活性
Reactome数据库ID版本77
4754232
数据库标识符。使用此URL将此实例的网页连接到Reactome:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=4754232
Reactome数据库ID版本77
5661121.
数据库标识符。使用此URL在反弹中连接到此实例的网页:http://www.reacontome.org/cgi-bin/eventbrowser?db=gk_current&id=5661121
反应途径
R-HSA-5661121
2
Reactome稳定的标识符。使用此URL连接到Reactome中的此实例的网页://www.joaskin.com/cgi-bin/eventbrowser_st_id?ST_ID=R-HSA-5661121.2
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