HSF1获得DNA结合活性是必要的，但对转录激活是不够的(Cotto JJ et al. 1996;Trinklein ND et al. 2004)。HSF1除了具有序列特异性的DNA结合域外，还包含一个参与激活靶基因转录的c端区域(Green M et al. 1995)。然而，转位激活域本身的转位能力不是应激敏感的。相反，它是由HSF1的一个调节域(氨基酸221-310)控制的，该域在正常生理条件下抑制转激活能力(Green M et al. 1995;左J等人1995;Newton EM等，1996)。HSF1的反活化结构域可以分为两个不同的区域，活化结构域1 (AD1)和活化结构域2 (AD2) (Brown SA et al. 1998)。AD1和AD2都含有对转录起始和延伸都很重要的残基。AD1和AD2酸性残基的突变优先影响HSF1刺激转录起始的能力，而苯丙氨酸残基的突变优先影响延长的刺激(Brown SA et al. 1998)。

dna结合但转录能力不强的HSF1的激活被认为是在应激诱导的HSF1的几个丝氨酸残基磷酸化时发生的(Ding XZ et al. 1997;Holmberg CI et al. 2001;Guettouche T et al. 2005)。在受热的细胞中，观察到HSE dna结合活性的获得先于HSF1的磷酸化(Cotto JJ et al. 1996;Kline MP & Morimoto RI 1997)。虽然有足够的证据表明，HSF1的磷酸化对调节HSF1的转激活能力至关重要，但应激刺激和相关激酶/磷酸酶背后的机制尚未明确。