路径浏览器

可视化并与反应性生物途径相互作用

分析工具

合并路径标识符映射,
过度表达与表达分析

ReactomeFIViz

旨在发现与癌症和其他类型疾病相关的途径和网络模式

文档

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为什么反应迟钝

Reactome是一个免费、开源、策划和同行评审的路径数据库。我们的目标是为路径知识的可视化、解释和分析提供直观的生物信息学工具,以支持基础研究、基因组分析、建模、系统生物学和教育。

如果您在亚洲使用Reactome,我们建议您使用我们的中文镜像网站reactome.ncpsb.org.cn.

欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)
纽约大学朗根健康中心
俄勒冈州健康与科学大学
安大略省癌症研究所

Reactome的开发得到了美国国立卫生研究院(U41 HG003751)和欧洲分子生物学实验室的资助。

推特

版本77于2021年6月14日发布

2,536

人体路径

13,827

反应

11,084

蛋白质

1,857

小分子

432

药物

33,752

文献参考

映射文件由一个制表符分隔的表组成,该表指示源数据库中哪些外部蛋白质、基因或小分子标识符被映射到反应组路径和反应注释。我们为每种不同的标识符类型分发三组文件的目标是提供这些映射文件,将源数据库标识符链接到:

  • 最低级别的路径图或路径子集
  • 所有级别路径图(文件名附加“所有级别”),
  • 所有反应事件。

映射文件中的列采用类似的格式:

  1. 源数据库标识符,例如UniProt、ENSEMBL、NCBI基因或ChEBI标识符
  2. 反应体途径稳定标识符
  3. 统一资源定位地址
  4. 事件(路径或反应)名称
  5. 证据代码

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