IDG Reactome

作为尖端信息工具(CEIT)照亮可用药(IDG)程序,Reactome小组已经建立了一个新的工具Reactome IDG门户,它利用了Reactome知识库系统地阐明暗蛋白与其他蛋白质和生物实体的相互作用,通过定位和潜在的相互作用来评估这些未被研究的蛋白质,并有助于设计实验来测试它们的功能。门户允许用户:

  • 搜索任何基因,并查看其在Reactome路径中的位置,基于人工注释或通过单跳配对关系的交互作用。
  • 将基于生化反应的图表转换成简单的成对网络。
  • 视图评分交互路径基于功能交互预测从一个随机森林模型训练了106个特征。
  • 为蛋白质-蛋白质成对关系或药物-靶标相互作用构建新的叠加和可视化。
  • 使用扩展的图表查看器来可视化蛋白质知识水平,并覆盖来自19个数据源的多个组织特异性表达值目标中央资源数据库

Reactome是安大略癌症研究所、纽约大学朗格尼医学中心、俄勒冈健康与科学大学和欧洲生物信息学研究所的小组之间的合作。Reactome的数据和软件在知识共享署名4.0许可的条款下发布。有关新内容和更新内容的完整描述可在Reactome网站上获得。在Twitter上关注我们:@reactome获得关于新路径、功能更新等内容的频繁更新。

阐明可药物基因组(IDG)计划,由国家卫生研究院(NIH)共同基金是一个多学科项目,旨在提高对三个关键蛋白家族成员的科学认识:非嗅觉g蛋白偶联受体(GPCRs)、离子通道和蛋白激酶。IDG计划的总体目标是促进目前尚待研究但对人类健康有很大影响的生物学领域的研究。在Twitter上关注我们:@DruggableGenome以接收有关程序的更新。

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