染色体盒（CBX）基因编码异染色质蛋白（HP）家族的成员。在果蝇中发现HP1是位置效应杂色的显性抑制因子和异染色质的主要成分。HP1家族在进化上是保守的，成员包括真菌、植物和动物。大多数动物都有几个HP1亚型；人类有分别由基因CBX5、CBX1和CBX3编码的HPα、β和gamme。
HP1氨基末端染色域结合组蛋白H3的甲基化赖氨酸-9，导致转录抑制（Lachner等人，2001年）。人类HP1α与H3K9（me）3肽复合物的晶体结构可用（Amaya等人，2008）。高度保守的羧基末端色影结构域可实现二聚，也可作为参与从转录到核结构等多种核功能的蛋白质的对接位点。