SMG1在体外和体内磷酸化UPF1（Denning等，2001年，Yamashita等，2001，Kashima等，2006）。在同种型2中的丝氨酸1073,1078,116和1116（同种型1的丝氨酸1084,1089,1107,1127）在体外磷酸化，在体内磷酸化1078和1096（yamashita等，2001，Ohnishi etal。2003，kashima等。2006）。UPF1还含有可磷酸化的额外丝氨酸和苏氨酸残基。SMG8和SMG9与SMG1相关联并调节SMG1的激酶活性（Yamashita等，2009）。磷酸化反应是废话介导的腐烂的速率限制，因此被视为许可步骤（在Rebbapragada和Lykke-Andersen 2009中审查）。外显子结络合物增强了磷酸化，其可以通过UPF2和/或UPF3与UPF1相互作用（Kashima等，2006，Ivanov等，2008）或通过Y14：Magoh（Ivanov等，2008）。SMG8和SMG9粘合SMG1并调节其激酶活动（Yamashita等，2009，Fernandez等人。2011）。