基于小鼠研究，转录因子ISL1与LHX3或LHX4复合物直接刺激SLIT2基因的转录。在鳃运动神经元和体运动神经元中，isl1介导的SLIT2基因转录调节分别涉及LHX4和LHX3 (Kim et al. 2016)。Isl1突变小鼠中Slit2表达减少(Lee et al. 2015)。
SLIT2是被转录因子ARX抑制的基因之一，参与神经元增殖、迁移、成熟和分化以及轴突引导(friocourte and Parnavelas, 2011)。
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