在人胚胎癌细胞中，在视黄酸激活HOXB1时，组蛋白H3 (H3K27me3)赖氨酸-27位点的甲基化丢失，而赖氨酸-4 (H3K4me3)位点的甲基化得到(Lan et al. 2007, Lee et al. 2007)。组蛋白去甲基化酶KDM6A (UTX)结合HOXB2染色质，可能使H3K27me3去甲基化(Lee et al. 2007)。其他因素也可能参与去甲基化。H3K27me3的缺失与polycomb抑制复合物2 (PRC2)的缺失有关(Lan et al. 2007, Lee et al. 2007)。KDM6A与组蛋白甲基转移酶KMT2C,D (mll2,3)形成复合物，可能参与H3K4的甲基化(Lee et al. 2007)。HOXB1染色质的激活可能是由远处3’维甲酸反应元件的常染色质扩散产生的。