GLI2蛋白的主要作用是作为h-依赖信号通路刺激的激活剂;在没有Hh配体的情况下，一小部分GLI2似乎被加工成抑制子形式，但大部分蛋白质被蛋白酶体完全降解(Briscoe and Therond, 2013)。GLI2的加工和降解都依赖于PKA、CK1和GSK3对多个丝氨酸残基的顺序磷酸化，类似于这些激酶在GLI3加工中的需求(Pan et al .， 2009;Pan et al .， 2006;潘和王，2007)。GLI2和GLI3的差异加工依赖于蛋白c端加工决定域(processing行列式domain, PDD)， PDD指导GLI3在没有Hh信号的情况下部分蛋白水解。从GLI3中替换2个氨基酸到GLI2蛋白中，就足以促进GLI2向抑制形式的高效加工(Pan和Wang, 2007)。