刺猬是一种分泌的形态学，通过调节CI / Gli转录因子家族的活性，通过调节身体组织的作用，在身体组织中具有进化的作用。在没有HH信号传导的果蝇中，通过蛋白酶体部分降解全长CI，以产生截头阻遏物形式，其转向细胞核以抑制HH-响应基因。HH配体与贴剂（PTC）受体的结合允许以未知的方式使7遍跨膜蛋白如未知的方式变平，破坏CI的部分蛋白水解并允许全长活化剂形式积聚（Ingham etal，2011; Briscoe和Therond，2013）。
虽然HH信号传导的许多核心组件从苍蝇保守到人类，但该途径确实显示出显着发散的点。值得注意的是，人类基因组编码三种Ci同源物，Gli1,2和3，每个Ci1,2和3，其在调节HH响应基因时起着稍微不同的作用。GLI3是脊椎动物中HH信号传导的主要阻遏物，并在不存在HH的情况下转化为截短的GLI3R阻遏物。Gli2是Hh存在下的有效转录活化剂，但仅贡献抑制功能。虽然在没有HH的情况下将少量Gli2蛋白质加工成阻遏物，但大多数由蛋白酶体完全降解或通过蛋白质 - 蛋白质相互作用以细胞溶溶胶的全长形式被隔离。GLI1缺乏镇压领域，似乎是一项迫使转录激活因子（在Briscoe和2013年审查）。
脊椎动物但不是飞行HH信号也取决于通过初级纤毛的途径组分的运动。初级纤维是一种基于非运动的微管结构，其结构和维护取决于肠道颗粒式（IFT）。朝向的IFT以轴突向睫状体碱移动到睫状体粒子的方式以需要微管 - 加端定向的Kinesin KIF3电动机和IFT-B蛋白质复合物的方式移动分子，而IFT-B蛋白质复合物，则逆行IFT回到睫状体基础取决于减去末端定向Dynein电机和IFT-A复合物。遗传筛鉴定了许多纤毛相关蛋白质，其需要在“关闭”状态下维持HH，并在激活途径时转发信号（在2011年汇和昂昂斯审查; Goetz和Anderson，2010）。