DNMT1将甲基从S-腺苷甲基硫氨酸转移到DNA中胞嘧啶残留物的胞嘧啶环的5-位。纯化的人DNMT1显示与未甲基化的CG基序相比，DNA中的半甲基化CG基序的偏好为7-21倍偏好（Pradhan等，1999），因此DNMT1倾向于通过DNA复制维持现有的甲基化。DNMT1的CXXC基序在对称未甲基化的CG二核苷酸中的胞嘧啶的结合可防止胞嘧啶对活性位点的进入，从而防止De Novo甲基化（Song等人。2011）。UHRF1将甲基化的半甲基化DNA和组蛋白H3尾粘合在赖氨酸-9上，并募集DNMT1至甲酸甲酯中甲基化DNA（Bostick等，2007年，在OOI和BESTOR 2008中审查）。UHRF1与DNMT1的相互作用增加了DNMT1约5倍的甲基化活性（Bashtrykov等，2014）。