B型肉毒毒素(botB，又称BoNT/B)是一种二硫键重链(HC) -轻链(LC)异质二聚体，通常由于食用受污染的食物(Hatheway 1995)进入肠道，作为一种与无毒非血凝素蛋白(NTNHA，由C. botulinum ntnha基因编码)和三种血凝素蛋白(HA，由C. botulinum ha17、ha34和ha70基因编码)的多个拷贝(Amatsu et al. 2013)。该复合物保护毒素不受肠道降解，并介导其与肠道上皮细胞的联系和胞转作用进入循环(Fujinaga等，2013年)。循环毒素分子与神经节苷脂和synaptotagmin (SYT)蛋白相关，通过靶神经元突触的胞外排泄暴露(Dong et al. 2003;Yowler & Schengrund 2004)。囊泡的循环将毒素带入神经元，囊泡已酸化(Sudhoff 2004)。降低的pH值引起毒素的构象变化:它的HC在囊泡膜中形成一个通道，通过这个通道，它的LC被挤压到神经元胞质中。HC - LC二硫键被还原(Montal 2010)。LC随后催化突触囊泡膜胞质面囊泡相关膜蛋白2 (VAMP2)的裂解(Foran et al. 1994;Schiavo et al. 1992)，从而抑制突触囊泡与质膜融合和胞外作用。