人类mtDNA是由一种专用的线粒体RNA聚合酶(POLRMT)转录的，它与噬菌体中发现的单体RNA聚合酶具有显著的序列相似性。与噬菌体T7 RNA聚合酶不同，POLRMT不能与启动子DNA相互作用，自身启动转录，需要线粒体转录因子A (TFAM)和转录因子B1 (TFB1M)或B2 (TFB2M)的存在。基础线粒体转录机制中的4个蛋白已以重组形式纯化，并用于体外重组含有DNA片段的启动子的转录(Falkenberg et al.， 2002)。虽然TFB1M和TFB2M都能支持体外POLRMT转录，但TFB2M的活性至少比TFB1M高出两个数量级，TFB1M在线粒体转录中的生理作用尚未完全确定。TFB1M和TFB2M与一个rRNA甲基转移酶家族的一级序列相似，该家族在核糖体生物发生期间将rRNA小亚基3'端附近的两个相邻的腺苷碱基二甲基化(Falkenberg et al.， 2002;McCulloch等人，2002年)。人TFB1M实际上是一种双重功能蛋白，在体外不仅支持线粒体转录，而且作为rRNA甲基转移酶(Seidel-Rogol et al.， 2003)。甲基转移酶的活性对于转录并不需要，因为TFB1M中保守的甲基转移酶基元的点突变显示，它在体外刺激转录独立于s -腺苷甲硫氨酸结合和rRNA甲基转移酶活性。