存在于人类线粒体呼吸链的80种不同蛋白质中，有13种是由线粒体基因组(mtDNA)编码的。在人类细胞中有1000到10000份的环状mtDNA，也编码2个核糖体rna和22个转移rna。双链线粒体基因组缺乏内含子，较长的非编码区包含mtDNA转录和复制的控制元件(Shadel和Clayton, 1997)。由于G+T含量不同，两条mtDNA链被称为重链(h链)和轻链(l链)。在人类细胞中，每条链包含一个单独的转录起始启动子，轻链启动子(LSP)或重链启动子(HSP)。线粒体启动子的转录产生多顺反子前体RNA，包含每条特定链中编码的所有遗传信息。初级转录本被处理以产生单独的tRNA和mRNA分子(Clayton, 1991;Ojala等人，1981年)。重链转录可能有第二个起始位点，它产生横跨rDNA区域的rna。最终的转录本包括两个线粒体rRNA的基因，并结束于16 S rRNA和tRNALeu(UUR)基因之间的边界(Montoya et al.， 1982; Montoya et al.,1983; Christianson and Clayton 1986). The existence of such a separate transcription unit may explain why the steady-state levels of rRNAs are much higher than the steady state levels of mRNAs.