成熟的吞噬体与内质网融合介导物质交换，从而形成杂交的ER-吞噬体隔间(Gagnon et al. 2002, Guermonprez et al. 2003, Houde et al. 2003, Ackerman et al. 2003, Blanchard et al. 2010)。这种杂交包含反转录转座子因子Sec61，介导蛋白酶体在吞噬体的胞质表面的进入。Houde等人(2003)利用荧光成像为Sec61在内化外源性蛋白从吞噬体反转位到J774巨噬细胞胞质面中的作用提供了证据。Sec61因子是由α、β和γ亚基组成的异三聚体复合物，构成哺乳动物ER易位子的核心(Greenfield et al. 1999)。Sec61复合物的低聚体形成了一个跨膜通道，参与了错误折叠的蛋白质从ER到细胞质的反转运以进行降解，因此有人提出Sec61可能参与了吞噬体中蛋白质到细胞质的转运(Kasturi et al. 2008)。