Hoxa4基因被转录产生mRNA (Behringer et al. 1993, Packer et al. 1998, Packer et al. 2000)。miRNA miR-196a-2、miR-196b和miRNA miR-222靶向Hoxa4 mRNA未翻译区域(Arnold et al. 2011)。Hoxa4 mRNA可在后脑节7 (Morrison et al. 1997)、中胚层(包括体节、肺和肾(Behringer et al. 1993, Packer et al. 1998, Packer et al. 2000)、胃喙背侧、前肠喙侧和大肠(Pitera et al. 1999)中观察到。
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