KRAB-ZNF / KAP互动

稳定的标识符
R-HSA-975040
类型
反应[绑定]
物种
HOMO SAPIENS.
舱室
路径的位置
一般
KRAB-ZNF / KAP互动
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Krab ZNF / KAP1内容复合体的形成:

含有C2H2锌指DNA结合基序(ZNFS)串联拷贝的转录因子是人蛋白质组中最丰富的TFS类别,包含1000多个成员。Krab ZnF蛋白是这些(具有423个成员)的最大子集,通过具有额外的保守结构域,KRAB结构域(Bellefroid,1991,Margolin,1994,Urrutia,2003,Huntley,2006)来定义。KRUPPEL相关框(KRAB)结构域是转录抑制领域(MARGOLIN,1994),其培养了KRAB-ZNF家族的特异性和专用CO压缩蛋白的募集 - KAP1 - 这是转录镇压和基因沉默所必需的(弗里德曼,1996)。

ZNF的转录因子较大型的家庭是存在于几乎所有的多细胞动物,通常它们的DNA结合特异性和转录调控职能果蝇保守到人类。虽然大多数ZNF转录因子的生物学功能是未知的,它们往往生物化学用作序列特异性DNA结合蛋白,并且可以是活化剂,或更oftenly观察到的,转录阻遏物,这取决于细胞环境。转录抑制在ZNF经由特定的蛋白蛋白相互作用介导的表面该功能为抑制结构域,通过招募特定共阻抑,诸如KAP1在人类(弗里德曼,1996),和dCTBP在果蝇(Nibu,1998)。

在反差比较大的ZNF家庭,KRAB-ZNFs只出现更晚在脊椎动物进化:亚科第一编码原始KRAB ZNF基因是在四足动物和家人已经在哺乳动物数量和复杂性得到了极大的扩展。有趣的是,KRAB-ZNFs的很大一部分只在灵长类动物中找到。除了他们的快速和动态的进化史,比较基因组学和灵长类动物KRAB-ZNFs表达的研究表明,这些基因在塑造灵长类特殊性状(亨特利,2006年,Nowick,2009年)一显著的作用。

Krab-ZNFS利用的生化途径是很好的定义,并且对于每个成员可能几乎相同:已经详细研究的所有KRAB-ZNF蛋白是阻遏物并利用Krab结构域结合KAP1的Co-re-压制剂。这种相互作用是直接的,具有高亲和力,并且对于在体内(Peng,2000A,B)中与DNA结合时,Krab-ZnF的用途是压缩机的.KAP1Co-抑制器似乎用作支架蛋白来组装并坐标多种酶(组蛋白脱乙酰酶,组蛋白甲基转移酶和异叶蛋白蛋白),其靶向和改变染色质结构,从而导致压实的沉默状态(Lechner,2000; Schultz,2001 Schultz,2002,Ayyanathan,2003)。KAP1通过SUMO的翻译后修饰控制了染色体(Ivanov,2007年Ivanov,2008)中组装酶机的能力。正式可能的是,一些Krab ZnF蛋白可以具有额外的功能域,其募集在特异性上下文中募集共觉器,因为这种双官能性对于许多类DNA结合转录因子常见。但是,目前没有实验证据。

还有就是很好的证据表明,KRAB ZNF-KAP1复杂的蛋白质具有长距离的基因沉默功能,通过染色质核复合体,通过组装沉默异染色质(Ayyanathan,2003)大量基因长距离的灭活转录。虽然KAP1最初被鉴定为特定的基因转录抑制的调解员,随后的研究表明KAP1也参与了HP1蛋白家族的同系物的募集(瑞安,1999年,Ayyanathan,2003;莱希纳,2000)。这些非组异相关的蛋白质首先被示出为具有在果蝇一个后生基因沉默功能以及最近在哺乳动物细胞。这些研究表明,KRAB ZNF蛋白质和KAP1也可能参与大规模的染色质调节和基因沉默,不只是在特定的基因转录抑制。这是否是大部分或全部KRAB ZNF蛋白质的一般属性将需要更多的研究。

最后,在哺乳动物几个含KRAB ZNFs还含有保守的SCAN域其中,像KRAB结构域还用作蛋白质蛋白质相互作用结构域。(埃德尔斯坦,2005年,彭德怀,2000A,B)。在SCAN域不参与结合KAP1而是功能介导同源二聚化,或选择性异二聚化用其它含SCAN蛋白质。然而,在KRAB-ZNF介导的抑制的SCAN域的生物化学和生物学功能是未知的。

剩下的问题:对KRAB-ZNFDs最重要的一个悬而未决的问题是确定它们的生物学功能。同时由KRAB ZNF / KAP1蛋白复合物来介导基因特异性转录抑制所使用的机构是众所周知的,更不用说知道关于他们所控制的特定的生物学途径。从靶基因的KRAB- ZNF263蛋白的近期全基因组分析的初步证据表明,它可以在其靶基因(Frietze,2010)的转录调控积极和消极影响。据推测,每个KRAB-ZNF,经由其阵列的锌指可结合在靶启动子的特异性DNA识别序列。此,每个基因的高度组织特异性表达相结合,使得由423 KRAB-ZNFs非常大的受控的电势转录。

文献参考文献
PUBMED ID 标题 杂志
8183939. Krüppel关联的盒子是有效的转录镇压域

马戈林,JF弗里德曼,JR.Meyer,WK.vsting,h蒂森,HJ.Rauscher FJ,3

Proc Natl Acad Sci U S a 1994年
16606702 人类Krab相关锌指基因的综合目录:洞察大家转录压缩机的进化史

亨特利,SBaggott,DM汉密尔顿,at.tran-gyamfi,m杨,斯金,J戈登,L.Branscomb,E.Stubbs,L.

基因组res. 2006年
10330177 KAP-1核心压抑蛋白与异络和欧洲HP1蛋白质相互作用和分析:krüppel相关盒 - 锌指蛋白在异铬胺介导的基因沉默中的潜在作用

Ryan,RF.Schultz,DCAyyanathan,K辛格,PB.弗里德曼,JR.弗雷德里克斯,WJRauscher FJ,3

mol细胞biol. 1999年
8769649. KAP-1,一种新型的辅阻遏物为高度保守的KRAB阻遏结构域

弗里德曼,JR.弗雷德里克斯,WJ詹森,德Speicher,DW.黄,XP尼尔森,例如Rauscher FJ,3

基因开发 1996年
14519192 Krab含锌手指阻遏蛋白

尿布,R.

基因组Biol. 2003年
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