野生型p16INK4A能够与CDK4或CDK6形成复合物，并阻止由CDK4或CDK6和d型细胞周期蛋白(CCND)组成的催化活性CDK复合物的形成。在癌症中发现的几个CDKN2A错义突变导致p16INK4A的氨基酸替换，削弱了p16INK4A突变体与CDK4的结合，而这些突变体与CDK6的结合被保留。功能测试的结合CDK6但不结合CDK4的p16INK4A突变体有:

p16INK4A R24P (Harland等人1997,Becker等人2001,Jones等人2007,McKenzie等人2010)
Ruas et al. 1999)
R112_L113insR (Ruas et al. 1999)

p16INK4A R24P部分抑制细胞增殖(Jones et al. 2007)，但其活性严重降低(Becker et al. 2001)。抑制细胞增殖的部分功能也归因于p16INK4A E88K (Ruas et al. 1999)，但缺乏实验证据。p16INK4A R112_L113insR抑制细胞增殖的能力尚未检测到。
许多p16INK4A错义突变体只检测了它们与CDK4结合的能力，而没有检测CDK6。CDK4结合受损但与CDK6结合尚未确定的突变体包括:

T18_A19dup (Kannengiesser et al. 2009)
p16INK4A G23D (Scaini et al. 2009, Kannengiesser et al. 2009, McKenzie et al. 2010)
p16INK4A G35A (Kannengiesser et al. 2009, McKenzie et al. 2010, Scaini et al. 2014)
p16INK4A G35V (Kannengiesser et al. 2009, McKenzie et al. 2010, Scaini et al. 2014)
p16INK4A A60R (Kannengiesser et al. 2009, McKenzie et al. 2010)
p16INK4A A60V (Kannengiesser et al. 2009, McKenzie et al. 2010)
p16INK4A G67_N71del (Kannengiesser et al. 2009)
p16INK4A D74Y (Kannengiesser et al. 2009)
p16INK4A T77P (Kannengiesser et al. 2009)
p16INK4A R80P (Kannengiesser et al. 2009)
p16INK4A L97R (Kannengiesser et al. 2009, McKenzie et al. 2010)
p16INK4A R99P (Kannengiesser et al. 2009, McKenzie et al. 2010)

p16INK4A G23D抑制cdk4介导的RB1磷酸化(Scaini et al. 2009)和抑制细胞增殖(Scaini et al. 2014)的能力下降。p16INK4A G35A和p16INK4A G35V (Scaini et al. 2014)、p16INK4A D74Y (Scaini et al. 2014)、p16INK4A R80P (Jenkins et al. 2013)和p16INK4A R99P (Jenkins et al. 2013)也证实了抑制细胞增殖的能力受损。
基于序列变化相似性，以下p16INK4A突变体尚未检测其与CDK4或CDK6的结合能力，但已在癌症中报道并预测具有致病性(COSMIC数据库:Forbes et al. 2017)，被注释为候选突变体:

p16INK4A分子G23S
p16INK4A分子G23V
p16INK4A分子G35E
p16INK4A分子G35R
p16INK4A分子G35W
p16INK4A分子A60E
p16INK4A分子室a60
p16INK4A分子t77
p16INK4A分子L97P

p16INK4A G23S和p16INK4A G23V抑制细胞增殖的能力降低(Scaini et al. 2014)。p16INK4A G35E和p16INK4A G35R抑制细胞增殖的能力明显受损，而p16INK4A G35W略有受损(Scaini et al. 2014)。p16INK4A D74N (p16INK4A Asp74Ans)未被注释，因为虽然预测其具有病原性，但它保留了结合CDK4和CDK6的能力(Yarbrough等人，1999年)。
一些p16INK4A突变的机制后果尚未阐明。例如，CDKN2A的外显子1 α发生错义突变，导致36位丙氨酸取代脯氨酸，从而只影响p16INK4A，从而导致p16INK4A A36P突变蛋白的表达。p16INK4A分子A36P保留能够绑定到(贝克尔et al . 2001年,尽管没有复制麦肯齐et al . 2010),但不能持续抑制CDK4-mediated磷酸化RB1 (Haferkamp et al . 2008年),和受损的能力诱导细胞周期阻滞(贝克等。2001年,Haferkamp et al . 2008年)。另一项研究表明，p16INK4A A36P保留了细胞周期阻滞诱导能力，但其调节细胞内氧化应激的能力受损(Jenkins et al. 2013)。