CASP9通常作为非活性单体前肽(procaspase - 9或酵素)存在。在细胞凋亡时，前aspase - 9的N端caspase招募域(CARD)通过同型相互作用与凋亡蛋白酶激活因子- 1 (APAF1)暴露的CARD结合(Qin H等，1999)。据估计，Procaspase-9与凋亡小体结合的比例为每7个APAF:细胞色素c (CYCS)分子2-5个酵素(Cheng TC et al. 2016)。凋亡小体的功能是促进CASP9的同型二聚体(Jiang X和Wang X 2000;Srinivasula et al. 2001;盐崎等，2002)。虽然CASP9的激活涉及二聚作用，但CASP9的蛋白水解可能不需要。未加工的CASP9具有很高的催化活性(Renatus et al. 2001;achan D et al. 2002)。此外，与其他启动caspases(包括caspases‑2、‑8和‑10)不同，CASP9的前域在凋亡过程中不会被移除; in fact, CASP9 (in both its procaspase‑9 and processed forms) must remain bound to the apoptosome to retain substantial catalytic activity (Bratton et al. 2001; Rodriguez and Lazebnik 1999). Once activated in the apoptosome, CASP9 dimer cleaves and activates procaspase‑3 and ‑7.