FOXO转录因子诱导几种负调控不同细胞类型增殖的基因表达，如红系祖细胞(Bakker et al. 2004, Wang et al. 2015)和端脑神经上皮祖细胞(Seoane et al. 2004)。
周期蛋白依赖性激酶(CDK)抑制剂CDKN1A (p21Cip1)的转录直接受到FOXO1、FOXO3和FOXO4的刺激(Seoane et al. 2004, Tinkum et al. 2013)。FOXO转录因子可以与SMAD2/3:SMAD4复合物合作，诱导CDKN1A转录响应tgf - β信号(Seoane et al. 2004)。
FOXO转录因子FOXO1、FOXO3和FOXO4刺激CDKN1B (p27Kip1)基因的转录，但FOXOs与CDKN1B基因位点的直接结合尚未被证实(Dijkers et al. 2000, Medema et al. 2000, Lees et al. 2008)。
FOXO3和FOXO4，可能还有FOXO1，直接刺激GADD45A基因的转录(Tran et al. 2002, Furukawa Hibi et al. 2002, Hughes et al. 2011, Sengupta et al. 2011, Ju et al. 2014)。
参与维持静止（G0）状态的视网膜母细胞瘤家族蛋白RBL2（p130）的转录直接受到FOXO1、FOXO3和FOXO4的刺激（Kops等人，2002年，Chen等人，2006年）。
抗增殖蛋白CCNG2的转录直接受到FOXO1和FOXO3的刺激，也可能受到FOXO4的刺激（Martinez-Gac等人，2004年，Chen等人，2006年）。抗增殖蛋白BTG1的转录直接受FOXO3刺激（Bakker等人，2004年，Bakker等人，2007年，Wang等人，2015年）。
编码caveolin-1的CAV1转录参与生长因子受体信号的负调控和静态细胞表型的建立，直接由FOXO1和FOXO3刺激（van den Heuvel等人，2005年，Roy等人，2008年，Nho等人，2013年，Sisci等人，2013年）。
FOXO1和FOXO3促进KLF4基因的转录，编码转录因子Krueppel-like factor 4，抑制小鼠B细胞的增殖(Yusuf et al. 2008)。
FOXO1与p-2S-SMAD2/3:SMAD4复合物一起刺激MSTN基因的转录，该基因编码肌生长抑制素，一种刺激成肌细胞分化的TGF-β家族成员（Allen和Unterman，2007）。