编码SPO11的基因与TopoVI (II型拓扑异构酶)序列相似。SPO11二聚体可切割两条DNA链。二聚体的每个亚基通过磷酸二酯连接到SPO11的一个保守的酪氨酸残基，共价连接到一条DNA链的5'端。除了SPO11，发芽酵母的研究表明，总共有7种蛋白质对双链断裂的形成至关重要。哺乳动物的同源基因Mei4 (S. cerevisiae)以及哺乳动物特有的基因Mei1对减数分裂双链断裂的形成至关重要。
核内脱氧核糖核酸酶活性，产生SPO11二聚体的5'-磷酸单酯[核质]
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