人类IRF3通过TBK1和/或IKKi介导的C-末端结构域中的两步磷酸化被激活。它需要Ser386和/或Ser385（位点1）以及Ser396和Ser405（位点2）之间的丝氨酸/苏氨酸残基簇（Panne et al.2007）。位点2的磷酸化残基减轻了自身抑制，从而允许与CBP（CREB结合蛋白）相互作用，并促进位点1的磷酸化。IRF3二聚化需要位点1的磷酸化。
IRF3和IRF7转录因子具有明显的结构特征；IRF7在Ser477和Ser479残基上磷酸化（Lin R等人，2000年）。TRAF6介导的IRF7泛素化也是IRF7磷酸化和激活所必需的。K-63连接的泛素化发生在人类IRF7的最后三个C端赖氨酸位点（位置444、446和452），独立于其C端功能性磷酸化位点。（Ning等人，2008年）。
