激活的雌激素受体α (ESR1)通过结合RUNX2近端P2启动子中的雌激素反应元件，直接刺激RUNX2基因转录。雌激素相关受体α (ESRRA)与RUNX2基因P2启动子的近端雌激素反应元件(EREs)或雌激素相关反应元件(ERREs)结合。在其PPARG1CA辅助因子的存在下，ESRRA刺激RUNX2的转录。在另一个辅助因子PPARG1CB的存在下，ESRRA抑制RUNX2的转录(Kammerer et al. 2013)。
RUNX2的转录是通过将TWIST1转录因子与RUNX2 P2启动子近端E1-box结合来刺激的(Yang et al. 2011)。
对小鼠的研究表明，RUNX2-P2可以通过与RUNX2基因近端P2启动子结合自动激活自身的表达(Ducy et al. 1999)。

基于小鼠研究，通过将地塞米松(DEXA)激活的糖皮质激素受体(NR3C1)与糖皮质激素受体反应元件(GRE)结合，RUNX2从近端启动子的转录被抑制，而GRE也存在于人类启动子中(Zhang et al. 2012)。DEXA和NR3C1复合物也可能通过直接与RUNX2蛋白结合而抑制RUNX2活性(Koromila et al. 2013)。