MAPK6在c端延伸的多个位点上被CDK1过度磷酸化，这种磷酸化与有丝分裂中MAPK6蛋白的稳定有关。残基S684、S688、T698和S705已被鉴定为CDK1的体外靶点，T698的磷酸化也已在体内被证实(Tanguay et al, 2010)。MAPK6在有丝分裂过程中过度磷酸化的作用尚未确定，尽管cdk1依赖的MAPK6磷酸化被描述为发生在细胞核中，但其作用位点也尚未确定。cdk1依赖的c末端过度磷酸化被CDC14A和B磷酸酶逆转(Tanguay et al, 2010;Hansen等人，2008)。