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MDC1-SUMO2(核浆)
稳定标识符
r - hsa - 5684062
类型
蛋白质(EntityWithAccessionedSequence)
物种
智人
室
核质
偶像
PathwayBrowser中的位置
全部展开
DNA修复(人类)
DNA双链断裂修复(智人)
同源定向修复(人类)
通过同源重组(HRR)或单链退火(SSA)的HDR(智人)
DNA双链断裂端的处理(智人)
PIAS4 SUMOylates MDC1(智人)
DNA DSB:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-核小体:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1:p-S102-WHSC1:RNF8:Zn2+:SUMO1:p-T4827-HERC2:UBE2N:UBE2V2:RNF168:PIAS4:p-SAPS25,S1778-TP53BP1:p-5S,2T-BRCA1-A复合物[核浆](同型)
DNA DSB:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-核小体:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1:p-S102-WHSC1:RNF8:Zn2+:SUMO1:p-T4827-HERC2:UBE2N:UBE2V2:RNF168:PIAS4:p-S25,S1778-TP53BP1[核浆](人)
DNA DSBs:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-Nucleosome:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1:p-S102-WHSC1:RNF8:Zn2+:SUMO1:p-T4827-HERC2:UBE2N:UBE2V2:RNF168:PIAS4[核质](智人)
DNA DSB:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-核小体:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1:p-S102-WHSC1[核浆](智人)
DNA DSB:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-核小体:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1[核浆](智人)
SUMO2:K1840,p-5T-MDC1二聚体[核质](智人)
SUMO2:K1840,p-5T-MDC1[核质](智人)
MDC1-SUMO2[核质](智人)
RNF4泛素化MDC1(智人)
DNA DSB:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-核小体:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1:p-S102-WHSC1:RNF8:Zn2+:SUMO1:p-T4827-HERC2:UBE2N:UBE2V2:RNF168:PIAS4:p-SAPS25,S1778-TP53BP1:p-5S,2T-BRCA1-A复合物[核浆](同型)
DNA DSB:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-核小体:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1:p-S102-WHSC1:RNF8:Zn2+:SUMO1:p-T4827-HERC2:UBE2N:UBE2V2:RNF168:PIAS4:p-S25,S1778-TP53BP1[核浆](人)
DNA DSBs:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-Nucleosome:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1:p-S102-WHSC1:RNF8:Zn2+:SUMO1:p-T4827-HERC2:UBE2N:UBE2V2:RNF168:PIAS4[核质](智人)
DNA DSB:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-核小体:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1:p-S102-WHSC1[核浆](智人)
DNA DSB:p-MRN:p-S1981,Ac-K3016-ATM:KAT5:K63PolyUb-K14,K16,p-S139-H2AFX,Me2K21-HIST1H4A-核小体:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1[核浆](智人)
SUMO2:K1840,p-5T-MDC1二聚体[核质](智人)
SUMO2:K1840,p-5T-MDC1[核质](智人)
MDC1-SUMO2[核质](智人)
k48polyb:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1二聚体[核质](智人)
K48PolyUb:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1[核质](智人)
MDC1-SUMO2[核质](智人)
外部参考信息
外部参照
UniProt: P61956 SUMO2
基因名字
SUMO2、SMT3B SMT3H2
链条
链:1-93,前肽:94-95
参考基因
BioGPS基因:6613 SUMO2
宇宙(基因):SUMO2 SUMO2
CTD基因:6613 SUMO2
dbSNP基因:6613 SUMO2
运用:ENSG00000188612 SUMO2
HGNC: 11125 SUMO2
KEGG基因(智人):6613 SUMO2
君主:6613苏默
NCBI基因:6613 SUMO2
人类:603042 SUMO2
UCSC:P61956 SUMO2
参考文本
参考序号:NM_006937.3 SUMO2
RefSeq: NM_001005849.1 SUMO2
其他标识符
0001770040
11716369 _x_at
11741526 _x_at
11753750_x_在
16848755
208738_3p_x_at
208738 _x_at
208739_x_在
211444_at
213881_3p_x_at
213881_x_在
3003031
3761609
3770624
3770625
3770633
3770634
3770635
3770636
3770637
3770638
3770641
3770642
3770643
4018870
4018872
41185 _f_at
6613
8018315
8174636
8178322
A_23_P107048
A_23_P118435
A_23_P310295
A_24_P330691
GE79270
GO:0003674
去:0003723
GO:0005515
GO:0005575
GO:0005622
GO:0005634
GO:0005654
GO:0006464
去:0008150
去:0009056
去:0009058
去:0016605
去:0016925
GO:0019789
GO:0019899
去:0031386
GO:0031625
去:0032436
去:0034641
GO:0043226
去:0044389
GO:0045944
HMNXSV003005390
HMNXSV003007837
Hs.180139.0.S2_3p_a_at
Hs.180139.0.S2_3p_x_at
Hs.180139.1.S1_3p_a_at
Hs.180139.1.S1_3p_x_at
ILMN_1738150
ILMN_2333594
PH_hs_0036913
TC17001873.hg
X99585_at
g12803928_3p_at
g5566605_3p_x_at
参与
作为
K48PolyUb:SUMO2:K1840,p-5T-MDC1[核质](智人)
SUMO2:K1840,p-5T-MDC1[核质](智人)
这个分子的其他形式
SUMO2(1 - 95)(核浆)
UBA2-G93-SUMO2[核质]
SUMO2[核质]
UBE2I-G93-SUMO2[核质]
推断
SUMO2[核质]
(家犬)
SUMO2[核质]
(背带背带)
SUMO2[核质]
(野猪)
sumo2[核质]
(鲐鱼类)
Sumo2(核浆)
(小家鼠)
Sumo2(核浆)
(褐家鼠)
改性残基
的名字
在93和1840处通过苏木酰化赖氨酸进行链间交联
协调
93
PsiMod名字
苏木酰化赖氨酸
PsiMod定义
一种蛋白质修饰,有效地将肽基赖氨酸的N6氨基与sumo(小泛素相关修饰物)蛋白质的羧基末端甘氨酸交联。
交叉引用
RefSeq
NP_001005849.1
,
NP_008868.3
开放目标
ENSG0000188612
基因卡
P61956
HPA
ENSG00000188612-SUMO2
运用
ENSP00000400886
,
ENST0000314523
,
ENST0000420826
,
ENSG0000188612
,
ENSP0000405965
箴
P61956
航标-目标
P61956
PDB
1 wz0
,
6JXW
,
2 iyd
,
2N1W
,
2 n9e
,
4BKG
,
1 z5q
,
2 io3
,
2 ckh
,
1 wm3
,
1 wm2
,
3 uio
,
4NPN
,
2 io0
,
5EQL
,
2 d07
,
3印尼
,
2AWT
,
5 ghc
,
5ELU
,
5迷奸
,
5D2M
,
3 zo5
,
6JXX
,
2RPQ
扶少团团员(23)
加入
#实体
实体
信心得分
证据(完整)
UniProt: P46060 RANGAP1
3.
RANGAP1(核被膜)
(r - hsa - 167661)
SUMO1-K524-RANGAP1(核被膜)
(r - hsa - 3000416)
RANGAP1[细胞溶胶]
(r - hsa - 376255)
0.75
6.
UniProt: Q9P0U3 SENP1
2.
SENP1[核质]
(r - hsa - 2984299)
SENP1[细胞溶胶]
(R-HSA-9715128)
0.743
6.
UniProt: Q9HC62 SENP2
1.
SENP2[核质]
(r - hsa - 2984298)
0.719
5.
UniProt:Q9UHP3 USP25
1.
USP25(胞质)
(HSR-96A)
0.718
6.
UniProt: Q12873 CHD3
2.
SUMO1-K1971-CHD3[核质]
(r - hsa - 8956372)
CHD3(核浆)
(r - hsa - 4657012)
0.668
3.
UniProt: Q8IZL8 PELP1
1.
PELP1[核质]
(R-HSA-3826531)
0.592
4.
UniProt: P63279 UBE2I
8.
UBE2I(核被膜)
(r - hsa - 4655408)
SUMO1-K14-UBE2I[核质]
(r - hsa - 4085358)
UBE2I[细胞溶胶]
(R-HSA-4655342)
SUMO1-C93-UBE2I[细胞溶胶]
(R-HSA-4656909)
SUMO3-C93-UBE2I(核浆)
(R-HSA-3730629)
SUMO2-C93-UBE2I[核质]
(R-HSA-3730619)
UBE2I[核质]
(R-HSA-912481)
SUMO1-C93-UBE2I[核质]
(R-HSA-3730617)
0.59
7.
UniProt:P38398 BRCA1
27
SUMO1-K109-BRCA1[核质]
(R-HSA-2997644)
SUMO2,3-BRCA1[核质]
(r - hsa - 2997624)
BRCA1 C64R[核质]
(r - hsa - 9700907)
BRCA1 C61G[核质]
(R-HSA-9700890)
BRCA1 C39Y(核浆)
(r - hsa - 9700938)
BRCA1 H41R[核质]
(r - hsa - 9700921)
BRCA1 C24R(核浆)
(R-HSA-9663198)
BRCA1 H41A(核浆)
(r - hsa - 9700927)
BRCA1 M18T[核质]
(r - hsa - 9700911)
BRCA1 C47G(核浆)
(r - hsa - 9700941)
BRCA1 C64G[核质]
(R-HSA-9700899)
BRCA1 C44F[核质]
(r - hsa - 9700944)
BRCA1 T37R[核质]
(r - hsa - 9700934)
BRCA1 C27A(核浆)
(r - hsa - 9700916)
BRCA1 H41Q[核质]
(r - hsa - 9700923)
BRCA1 Q12Tfs*5[核质]
(r - hsa - 9700953)
BRCA1 E23Afs * 18(核浆)
(r - hsa - 9700959)
BRCA1 C61Y(核浆)
(R-HSA-9700894)
BRCA1 C24F(核浆)
(R-HSA-9663206)
BRCA1 E23Rfs * 18(核浆)
(R-HSA-9700960)
BRCA1 E23Vfs*17[核质]
(R-HSA-9700967)
p-S988、S1387、S1423、S1524、S1547-BRCA1[核质]
(r - hsa - 5683800)
K6PolyUb、p-S988 S1387、S1423 S1524, S1547-BRCA1(核浆)
(r - hsa - 9707298)
BRCA1[核质]
(r - hsa - 50949)
K6PolyUb-BRCA1[核质]
(r - hsa - 9701022)
K6PolyUb,p-S1387,S1423,S1524,S1547-BRCA1[核质]
(r - hsa - 9707290)
p-S1387、S1423、S1524、S1547-BRCA1[核质]
(R-HSA-75234)
0.589
2.
UniProt: Q5W0Q7 USPL1
0.573
2.
UniProt:Q6DRC5 USPL1
0.558
2.
UniProt:Q13569 TDG
3.
SUMO1-K330-TDG(核浆)
(R-HSA-4551718)
SUMO2,3-K330-TDG[核质]
(R-HSA-4551628)
TDG[核质]
(R-HSA-65812)
0.558
2.
UniProt:P23497-2 SP100
0.556
3.
UniProt: Q8IX15-3 HOMEZ
0.556
3.
UniProt:O15060 ZBT39
0.556
3.
UniProt: Q86T24 KAISO
0.556
3.
UniProt:Q96IT1 ZNF496
1.
ZNF496(核浆)
(R-HSA-1247860)
0.556
3.
完整:EBI-16436244 CCSB ORF ID
0.556
3.
UniProt: Q15047 SETDB1
1.
SETDB1[核质]
(r - hsa - 417136)
0.553
2.
UniProt: P08670 VIM
11
VIM(86 - 466)(胞质)
(r - hsa - 350294)
VIM(2 - 85)(胞质)
(R-HSA-350264)
VIM(430-466)[胞浆]
(r - hsa - 350316)
VIM(2 - 429)(胞质)
(r - hsa - 350317)
VIM(260 - 466)(胞质)
(r - hsa - 350314)
VIM(2-259)[胞浆]
(R-HSA-350323)
VIM(胞质)
(R-HSA-201600)
波形蛋白[晚期核内体腔]
(R-HSA-9660019)
Vimentin[微管组织中心]
(R-HSA-9657898)
波形蛋白[细胞质]
(r - hsa - 9646687)
波形蛋白(溶酶体腔)
(R-HSA-9659977)
0.553
2.
UniProt: P10242 MYB
1.
MYB(核浆)
(R-HSA-992697)
0.544
3.
UniProt: O88846
1.
Rnf4[细胞溶胶]
(r -优化- 975974)
0.544
2.
UniProt: Q8N2W9 PIAS4
2.
SUMO1-K35-PIAS4[核质]
(r - hsa - 3968415)
PIAS4(核浆)
(r - hsa - 2993789)
0.508
3.
UniProt:Q92844油箱
2.
坦克(胞质)
(r - hsa - 933407)
K63polyUb-TANK(胞质)
(r - hsa - 5362480)
0.499
3.
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