从小鼠同源物中推断出，HOXA2表达由R3和R5中的菱形4（R4）和EGR2（Krox20）中的HoxB1驱动。Hoxb1与PBX和Prep / Meis Cofactor一起绑定在Hoxa2的内含子中的元素。（Hoxa2是R2中唯一活性的Hox基因。未知的活化剂，可能是SOX系列的转录因子，可以参与R2中的表达。）
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