IFT复杂被认为是由六个组件组成：WDR19 / IFT144，IFT140，IFT122，TTC21B / IFT139，WDR35 / IFT121和IFT43（PIPERNO等，1998; COLE和SNELL，2009;在TASCHNER等，2012中审查）。这些蛋白质中的每一个被鉴定为人体细胞中的TulP3相互作用蛋白质，支持在其他生物中建立的概念，即它们是IFT复合物的所有组分（Mukhopadhyay等，2010;在Taschner等，2012中审查）。IFT蛋白质大，通常具有类似的结构域组织，由N末端WD基序和C末端TPR重复组成。这些蛋白质相互作用域可以帮助IFT的复杂支架募集IFT B复合物，以及募集睫状料和电机蛋白质。有趣的是，IFT蛋白的结构域结构类似于核偶蛋白和涂层蛋白质的结构域结构，并且已经提出它们从外套蛋白前体演变，这与囊泡贩运中的作用一致（Devos等，2004; Jekely和Arendt，2006）。
IFT内蛋白质 - 蛋白质相互作用的细节是不知道的，也不是人类细胞中的方式和位置的细节。