线粒体异柠檬酸脱氢酶IDH2催化异柠檬酸和NADP+的不可逆反应生成α酮戊二酸、CO2和NADPH + H+ (Hartong et al. 2008)。人类活性酶的结构尚未通过实验确定，但根据对同源猪酶的详细研究推断，它是一个同源二聚体，每个亚基上都有一个Mn++结合(Ceccarelli et al. 2002)。在哺乳动物TCA循环的生化研究中，nadp特异的IDH2是第一个被表征的异柠檬酸脱氢酶同酶(Ochoa 1948)。以后的工作用酵母透露的存在都NADP-specific (IDH2-homologous)和NAD-specific (IDH3-homologous)酶和证明了后者的ADP-dependence(1951年科恩伯格和定价的人),现在被广泛接受的观点一致IDH3介导异柠檬酸的转化率alpha-ketoglutarate柠檬酸循环。因此，IDH2的生理功能尚不清楚。最近的观察发现，在大多数组织中，IDH3突变的纯合个体急剧降低其活性，并没有表现出能量代谢不足的症状，这提出了IDH2反应可能在TCA循环中发挥辅助作用的可能性(Hartong et al. 2008)。