通过β-连环蛋白和TCF / LEF调节的基因涉及一个不同的范围在细胞增殖，分化，胚胎发生和组织稳态的功能，和包括转录因子，细胞周期调节剂，生长因子，蛋白酶和炎症性细胞因子，等等（在弗拉德等，2008）审查。许多WNT信号元件本身是TCF / LEF依赖的转录的积极或消极的调控目标，建立反馈循环，以增强或限制信号（见例如，汗等，2007;查莫罗等，2005;卢斯等人，1999年; Lustig等人，2002）。除了少数的这些一般的反馈目标（例如的Axin2），大多数的靶基因是细胞和/或组织特异性的。WNT /β-连环蛋白依赖性的靶基因的列表保持在http://www.standford.edu/group/nusselab/cgi-bin/wnt/target_genes。