EPH/Ephrin信号与Rho家族GTPases(如Rac、Rho和Cdc42)耦合，连接双向受体-配体相互作用与肌动蛋白细胞骨架的变化(Noren & Pasquale 2004, Groeger & Nobes 2007)。RHOA调节肌动蛋白动态，参与epha诱导的生长锥崩塌。这是由ephexins介导的。Ephexin是Rho GTPases的一种鸟嘌呤核苷酸交换因子，它与epa激酶结构域相互作用，其随后的激活会不同程度地影响Rho GTPases，因此RHOA被激活，而Cdc42和Rac1被抑制。RHOA的激活，以及Cdc42和Rac的抑制，使肌动蛋白细胞骨架转变为增加收缩和减少扩张，导致生长锥坍塌(Shamah et al. 2001, Sahin et al. 2005)。生长神经元中EPH受体的激活通常(但不总是)会导致生长锥塌陷反应和从ephrin表达底物的回缩(Poliakov et al. 2004, Pasquale 2005)。epha介导的排斥反应阻止轴突生长到ephrin-A浓度过高的区域，如上丘的后端(Pasquale 2005)。