辛德聚糖附着硫酸肝素(HS)和较轻程度的硫酸软骨素(CS)链。这些允许与大量蛋白质相互作用。参与翻译后HS链修饰的各种酶产生独特的结合基模，选择性地识别不同的蛋白质(Tkachenko et al. 2005)。与HS链合成或修饰缺陷的小鼠相比，syndecan缺失小鼠具有微妙的表型(Echtermeyer et al. 2001, ishquro et al. 2001, Götte et al. 2002)。gpi锚定的glypicans和基质HSPGs(如perlecan)可以弥补syndecans的缺失。

Syndecans也是信号分子，与细胞质蛋白相互作用。Syndecan-2结合贩运蛋白颗粒复合物亚基4 (TRAPPC4)，也称为synbindin。它似乎与突触后膜运输有关(Ethell et al. 2000)。Syndecan-2表达促进神经元树突棘成熟，并需要C2结构域(Ethell et al. 2000)，这表明Syndecan-2和synbindin将胞内囊泡招募到突触后位置。最近，TRAPPC4被证明是运输蛋白颗粒的组成部分，参与内质网到高尔基体的运输(Fan et al. 2009)。