有活性的Gt α (GNAT-GTP)可以被缓慢的、固有的GTP酶活性灭活，该酶将GTP水解为GDP。一旦GNAT1与GDP结合，它不再与PDE6的γ亚基(PDE6- γ)结合，然后恢复对PDE6催化亚基的抑制。三磷酸鸟苷的水解是加速了一个缺口(GTPase加速蛋白质)复杂,由监管机构的G蛋白信号9 (RGS9-1, RGS9同种型3)(他et al . 1998年,Zhang et al . 1999年),鸟嘌呤核苷酸结合蛋白β亚基5,长形式(GNB5)(牧野et al . 1999年)和RGS9锚定蛋白(RGS9BP,即R9AP) (Hu & Wensel, 1998)。GNAT - GTP对GAP配合物的亲和力相对较低，但PDE-gamma的存在显著提高了其亲和力。Gt的关闭是恢复棒的单光子响应的限速步骤(Chen et al. 2000, Krispel et al. 2006)。GAP缺陷患者会出现视慢或“视觉慢”，难以适应亮度变化和跟踪移动物体(Michaelides et al. 2010, Nishiguchi et al. 2004)。