病毒基因组RNA（vRNA的）和互补RNA（cRNA的）有可能由流感核蛋白（NP）在合成时立即结合。尽管2个核定位信号已经在NP，一种非常规的N-末端和NLS的二分NLS氨基酸198-216（;诺伊曼，1997;王，1997小泽，2007）中被映射时，NP的晶体结构表明，只有非常规NLS被暴露并且可被用作功能NLS（叶，2006）。与importinsα-1和-2这个unconvenetional NLS相互作用（克罗等人，2005; Wang等人，1997; Buolo等人，2006）。NP的三维结构显示，NP分子结合作为三聚体，通过β-片层B5，B6，B7和在蛋白质的C-末端结构域相互作用;病毒RNA容易缠绕的复合体（叶，2006年）的外侧。
