Rape等人最近证明APC/C靶向蛋白降解的顺序是由这些底物的多泛素化过程决定的。加工底物在与APC/C结合一次后获得多聚泛素链并被降解。在获得足够长的泛素链以确保降解之前，分布底物与APC/C多次结合、解离和再结合。此外，从具有短泛素链的APC/C中分离的分布底物是去泛素化的目标(Rape et al.， 2006)。矛盾的是，尽管cyclin A的多泛素化是分布的，APC-Cdc20的后期底物如Securin是渐进的(Rape et al.， 2006)，但cyclin A在Securin和cyclin b之前就被降解了。确保这一顺序的机制尚未确定。