在哺乳动物中,对病毒感染的应答是通过TRAF-相互作用基序IPS-1和TRAFs的(TIM),它可以募集其他分子进入信号复合物[叶H等人2002,许LG等人之间的直接和特异性相互作用介导的2005年,2006年SK萨哈等人,今野H等人2009]。IPS-1海港几个不同的TIM。一个基序位于氨基酸143-PVQET-147和结合二者TRAF2和TRAF3,而TRAF6排他性地结合至氨基酸153-PGENSE-158 455 PEENEY-460基序。在哺乳动物IPS-1介导响应病毒感染而要求:
- TRAF6激活的NFκB,MAPK和IRF7,但不是IRF3。[许LG等人2005,吉田R等人,2009,今野H等人2009]。
- TRAF3以激活IRF3和IRF7 [萨哈SK等人,2006,Oganesyan G等人,2006]。
- TRAF2激活p38蛋白,有助于诱导的NFκB[米克尔森SS等人2009年,徐LG等人,2005]。
预测鸡TRAF2,TRAF3和TRAF6蛋白显示75,82和73%的氨基酸分别序列同一性的其人对应物。在这个项目中,我们假设鸡TRAF蛋白质的功能相似,在病毒感染哺乳动物TRAFs。